Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tcirg1Q9JHF5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tcirg1Q9JHF5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tcirg1Q9JHF5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcirg1Q9JHF5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcirg1Q9JHF5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcirg1Q9JHF5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcirg1Q9JHF5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcirg1Q9JHF5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcirg1Q9JHF5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcirg1Q9JHF5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcirg1Q9JHF5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcirg1Q9JHF5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcirg1Q9JHF5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcirg1Q9JHF5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcirg1Q9JHF5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcirg1Q9JHF5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcirg1Q9JHF5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcirg1Q9JHF5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcirg1Q9JHF5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcirg1Q9JHF5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcirg1Q9JHF5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcirg1Q9JHF5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcirg1Q9JHF5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcirg1Q9JHF5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcirg1Q9JHF5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcirg1Q9JHF5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcirg1Q9JHF5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcirg1Q9JHF5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcirg1Q9JHF5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcirg1Q9JHF5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcirg1Q9JHF5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcirg1Q9JHF5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcirg1Q9JHF5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcirg1Q9JHF5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcirg1Q9JHF5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tcirg1Q9JHF5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tcirg1Q9JHF5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcirg1Q9JHF5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcirg1Q9JHF5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcirg1Q9JHF5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcirg1Q9JHF5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcirg1Q9JHF5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcirg1Q9JHF5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcirg1Q9JHF5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcirg1Q9JHF5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcirg1Q9JHF5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcirg1Q9JHF5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcirg1Q9JHF5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcirg1Q9JHF5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcirg1Q9JHF5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcirg1Q9JHF5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcirg1Q9JHF5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcirg1Q9JHF5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcirg1Q9JHF5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcirg1Q9JHF5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcirg1Q9JHF5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcirg1Q9JHF5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcirg1Q9JHF5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcirg1Q9JHF5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcirg1Q9JHF5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcirg1Q9JHF5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcirg1Q9JHF5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcirg1Q9JHF5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcirg1Q9JHF5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcirg1Q9JHF5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcirg1Q9JHF5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcirg1Q9JHF5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcirg1Q9JHF5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcirg1Q9JHF5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Tcirg1Q9JHF5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcirg1Q9JHF5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcirg1Q9JHF5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcirg1Q9JHF5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcirg1Q9JHF5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcirg1Q9JHF5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcirg1Q9JHF5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcirg1Q9JHF5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcirg1Q9JHF5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcirg1Q9JHF5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcirg1Q9JHF5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcirg1Q9JHF5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcirg1Q9JHF5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcirg1Q9JHF5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcirg1Q9JHF5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcirg1Q9JHF5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcirg1Q9JHF5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcirg1Q9JHF5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcirg1Q9JHF5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcirg1Q9JHF5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcirg1Q9JHF5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcirg1Q9JHF5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcirg1Q9JHF5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcirg1Q9JHF5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcirg1Q9JHF5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcirg1Q9JHF5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcirg1Q9JHF5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcirg1Q9JHF5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcirg1Q9JHF5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms