Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pgpep1Q9ESW8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms