Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESU6

Brd4, Bromodomain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd4Q9ESU6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Brd4Q9ESU6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Brd4Q9ESU6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Brd4Q9ESU6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Brd4Q9ESU6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Brd4Q9ESU6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Brd4Q9ESU6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
Brd4Q9ESU6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Brd4Q9ESU6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Brd4Q9ESU6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Brd4Q9ESU6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Brd4Q9ESU6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Brd4Q9ESU6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Brd4Q9ESU6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Brd4Q9ESU6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Brd4Q9ESU6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
Brd4Q9ESU6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Brd4Q9ESU6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Brd4Q9ESU6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Brd4Q9ESU6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
Brd4Q9ESU6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Brd4Q9ESU6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Brd4Q9ESU6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Brd4Q9ESU6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
Brd4Q9ESU6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Brd4Q9ESU6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
Brd4Q9ESU6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
Brd4Q9ESU6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Brd4Q9ESU6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Brd4Q9ESU6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
Brd4Q9ESU6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Brd4Q9ESU6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Brd4Q9ESU6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Brd4Q9ESU6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Brd4Q9ESU6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Brd4Q9ESU6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Brd4Q9ESU6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Brd4Q9ESU6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Brd4Q9ESU6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Brd4Q9ESU6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Brd4Q9ESU6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Brd4Q9ESU6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Brd4Q9ESU6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Brd4Q9ESU6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
Brd4Q9ESU6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Brd4Q9ESU6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
Brd4Q9ESU6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Brd4Q9ESU6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Brd4Q9ESU6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Brd4Q9ESU6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Brd4Q9ESU6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Brd4Q9ESU6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Brd4Q9ESU6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Brd4Q9ESU6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Brd4Q9ESU6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Brd4Q9ESU6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Brd4Q9ESU6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
Brd4Q9ESU6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Brd4Q9ESU6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Brd4Q9ESU6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Brd4Q9ESU6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Brd4Q9ESU6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Brd4Q9ESU6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
Brd4Q9ESU6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
Brd4Q9ESU6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Brd4Q9ESU6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Brd4Q9ESU6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Brd4Q9ESU6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Brd4Q9ESU6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Brd4Q9ESU6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Brd4Q9ESU6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Brd4Q9ESU6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
Brd4Q9ESU6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Brd4Q9ESU6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
Brd4Q9ESU6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Brd4Q9ESU6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Brd4Q9ESU6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Brd4Q9ESU6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Brd4Q9ESU6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Brd4Q9ESU6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Brd4Q9ESU6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Brd4Q9ESU6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Brd4Q9ESU6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Brd4Q9ESU6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Brd4Q9ESU6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Brd4Q9ESU6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Brd4Q9ESU6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Brd4Q9ESU6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Brd4Q9ESU6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Brd4Q9ESU6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Brd4Q9ESU6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Brd4Q9ESU6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Brd4Q9ESU6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Brd4Q9ESU6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Brd4Q9ESU6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Brd4Q9ESU6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
Brd4Q9ESU6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Brd4Q9ESU6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
Brd4Q9ESU6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Brd4Q9ESU6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms