Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn12Q9ER56 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn12Q9ER56 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn12Q9ER56 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn12Q9ER56 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn12Q9ER56 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn12Q9ER56 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn12Q9ER56 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capn12Q9ER56 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capn12Q9ER56 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capn12Q9ER56 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capn12Q9ER56 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capn12Q9ER56 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capn12Q9ER56 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Capn12Q9ER56 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capn12Q9ER56 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn12Q9ER56 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn12Q9ER56 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn12Q9ER56 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn12Q9ER56 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn12Q9ER56 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capn12Q9ER56 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capn12Q9ER56 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capn12Q9ER56 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capn12Q9ER56 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capn12Q9ER56 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Capn12Q9ER56 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Capn12Q9ER56 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Capn12Q9ER56 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Capn12Q9ER56 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Capn12Q9ER56 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Capn12Q9ER56 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Capn12Q9ER56 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn12Q9ER56 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn12Q9ER56 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn12Q9ER56 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn12Q9ER56 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn12Q9ER56 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capn12Q9ER56 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capn12Q9ER56 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capn12Q9ER56 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capn12Q9ER56 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capn12Q9ER56 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capn12Q9ER56 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capn12Q9ER56 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capn12Q9ER56 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Capn12Q9ER56 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capn12Q9ER56 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Capn12Q9ER56 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capn12Q9ER56 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capn12Q9ER56 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capn12Q9ER56 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capn12Q9ER56 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capn12Q9ER56 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn12Q9ER56 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn12Q9ER56 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn12Q9ER56 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn12Q9ER56 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn12Q9ER56 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn12Q9ER56 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn12Q9ER56 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn12Q9ER56 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn12Q9ER56 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn12Q9ER56 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn12Q9ER56 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn12Q9ER56 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn12Q9ER56 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn12Q9ER56 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn12Q9ER56 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn12Q9ER56 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn12Q9ER56 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn12Q9ER56 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn12Q9ER56 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn12Q9ER56 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn12Q9ER56 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn12Q9ER56 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn12Q9ER56 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn12Q9ER56 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn12Q9ER56 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn12Q9ER56 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn12Q9ER56 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn12Q9ER56 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn12Q9ER56 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn12Q9ER56 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn12Q9ER56 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn12Q9ER56 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn12Q9ER56 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn12Q9ER56 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn12Q9ER56 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn12Q9ER56 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn12Q9ER56 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn12Q9ER56 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn12Q9ER56 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn12Q9ER56 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn12Q9ER56 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn12Q9ER56 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn12Q9ER56 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn12Q9ER56 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn12Q9ER56 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn12Q9ER56 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms