Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ropn1lQ9EQ00 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ropn1lQ9EQ00 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ropn1lQ9EQ00 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ropn1lQ9EQ00 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ropn1lQ9EQ00 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ropn1lQ9EQ00 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ropn1lQ9EQ00 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ropn1lQ9EQ00 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ropn1lQ9EQ00 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ropn1lQ9EQ00 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ropn1lQ9EQ00 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ropn1lQ9EQ00 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ropn1lQ9EQ00 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ropn1lQ9EQ00 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ropn1lQ9EQ00 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ropn1lQ9EQ00 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ropn1lQ9EQ00 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ropn1lQ9EQ00 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ropn1lQ9EQ00 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ropn1lQ9EQ00 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ropn1lQ9EQ00 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ropn1lQ9EQ00 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ropn1lQ9EQ00 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ropn1lQ9EQ00 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ropn1lQ9EQ00 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ropn1lQ9EQ00 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ropn1lQ9EQ00 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ropn1lQ9EQ00 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ropn1lQ9EQ00 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ropn1lQ9EQ00 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ropn1lQ9EQ00 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ropn1lQ9EQ00 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ropn1lQ9EQ00 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ropn1lQ9EQ00 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ropn1lQ9EQ00 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ropn1lQ9EQ00 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ropn1lQ9EQ00 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ropn1lQ9EQ00 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ropn1lQ9EQ00 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ropn1lQ9EQ00 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ropn1lQ9EQ00 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ropn1lQ9EQ00 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ropn1lQ9EQ00 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ropn1lQ9EQ00 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ropn1lQ9EQ00 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ropn1lQ9EQ00 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ropn1lQ9EQ00 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ropn1lQ9EQ00 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ropn1lQ9EQ00 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ropn1lQ9EQ00 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ropn1lQ9EQ00 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ropn1lQ9EQ00 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ropn1lQ9EQ00 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ropn1lQ9EQ00 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ropn1lQ9EQ00 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ropn1lQ9EQ00 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ropn1lQ9EQ00 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ropn1lQ9EQ00 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ropn1lQ9EQ00 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ropn1lQ9EQ00 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ropn1lQ9EQ00 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ropn1lQ9EQ00 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ropn1lQ9EQ00 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ropn1lQ9EQ00 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ropn1lQ9EQ00 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ropn1lQ9EQ00 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ropn1lQ9EQ00 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ropn1lQ9EQ00 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ropn1lQ9EQ00 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ropn1lQ9EQ00 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ropn1lQ9EQ00 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ropn1lQ9EQ00 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ropn1lQ9EQ00 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ropn1lQ9EQ00 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ropn1lQ9EQ00 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ropn1lQ9EQ00 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ropn1lQ9EQ00 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ropn1lQ9EQ00 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ropn1lQ9EQ00 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ropn1lQ9EQ00 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ropn1lQ9EQ00 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ropn1lQ9EQ00 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ropn1lQ9EQ00 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ropn1lQ9EQ00 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ropn1lQ9EQ00 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ropn1lQ9EQ00 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ropn1lQ9EQ00 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ropn1lQ9EQ00 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ropn1lQ9EQ00 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ropn1lQ9EQ00 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ropn1lQ9EQ00 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ropn1lQ9EQ00 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ropn1lQ9EQ00 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ropn1lQ9EQ00 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ropn1lQ9EQ00 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ropn1lQ9EQ00 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ropn1lQ9EQ00 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ropn1lQ9EQ00 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ropn1lQ9EQ00 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms