Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ndufa8Q9DCJ5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ndufa8Q9DCJ5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ndufa8Q9DCJ5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ndufa8Q9DCJ5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ndufa8Q9DCJ5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ndufa8Q9DCJ5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ndufa8Q9DCJ5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ndufa8Q9DCJ5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ndufa8Q9DCJ5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ndufa8Q9DCJ5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ndufa8Q9DCJ5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ndufa8Q9DCJ5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ndufa8Q9DCJ5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ndufa8Q9DCJ5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ndufa8Q9DCJ5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ndufa8Q9DCJ5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ndufa8Q9DCJ5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ndufa8Q9DCJ5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ndufa8Q9DCJ5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ndufa8Q9DCJ5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ndufa8Q9DCJ5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ndufa8Q9DCJ5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ndufa8Q9DCJ5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ndufa8Q9DCJ5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ndufa8Q9DCJ5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ndufa8Q9DCJ5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ndufa8Q9DCJ5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ndufa8Q9DCJ5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ndufa8Q9DCJ5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ndufa8Q9DCJ5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ndufa8Q9DCJ5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ndufa8Q9DCJ5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ndufa8Q9DCJ5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ndufa8Q9DCJ5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ndufa8Q9DCJ5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ndufa8Q9DCJ5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ndufa8Q9DCJ5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ndufa8Q9DCJ5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ndufa8Q9DCJ5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ndufa8Q9DCJ5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ndufa8Q9DCJ5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ndufa8Q9DCJ5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ndufa8Q9DCJ5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ndufa8Q9DCJ5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ndufa8Q9DCJ5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ndufa8Q9DCJ5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ndufa8Q9DCJ5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ndufa8Q9DCJ5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ndufa8Q9DCJ5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ndufa8Q9DCJ5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ndufa8Q9DCJ5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ndufa8Q9DCJ5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ndufa8Q9DCJ5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ndufa8Q9DCJ5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ndufa8Q9DCJ5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ndufa8Q9DCJ5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ndufa8Q9DCJ5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ndufa8Q9DCJ5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ndufa8Q9DCJ5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ndufa8Q9DCJ5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ndufa8Q9DCJ5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ndufa8Q9DCJ5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ndufa8Q9DCJ5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ndufa8Q9DCJ5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ndufa8Q9DCJ5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ndufa8Q9DCJ5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ndufa8Q9DCJ5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ndufa8Q9DCJ5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ndufa8Q9DCJ5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ndufa8Q9DCJ5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ndufa8Q9DCJ5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ndufa8Q9DCJ5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ndufa8Q9DCJ5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ndufa8Q9DCJ5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ndufa8Q9DCJ5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ndufa8Q9DCJ5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ndufa8Q9DCJ5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ndufa8Q9DCJ5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ndufa8Q9DCJ5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ndufa8Q9DCJ5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ndufa8Q9DCJ5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ndufa8Q9DCJ5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ndufa8Q9DCJ5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ndufa8Q9DCJ5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ndufa8Q9DCJ5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ndufa8Q9DCJ5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ndufa8Q9DCJ5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ndufa8Q9DCJ5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ndufa8Q9DCJ5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ndufa8Q9DCJ5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ndufa8Q9DCJ5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ndufa8Q9DCJ5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ndufa8Q9DCJ5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ndufa8Q9DCJ5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ndufa8Q9DCJ5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ndufa8Q9DCJ5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ndufa8Q9DCJ5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms