Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB3

MNCb-2875, Putative uncharacterized protein FLJ38447 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNCb-2875Q9DCB3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MNCb-2875Q9DCB3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
MNCb-2875Q9DCB3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MNCb-2875Q9DCB3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MNCb-2875Q9DCB3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MNCb-2875Q9DCB3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
MNCb-2875Q9DCB3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MNCb-2875Q9DCB3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MNCb-2875Q9DCB3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MNCb-2875Q9DCB3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MNCb-2875Q9DCB3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MNCb-2875Q9DCB3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
MNCb-2875Q9DCB3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MNCb-2875Q9DCB3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MNCb-2875Q9DCB3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MNCb-2875Q9DCB3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MNCb-2875Q9DCB3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MNCb-2875Q9DCB3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MNCb-2875Q9DCB3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MNCb-2875Q9DCB3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MNCb-2875Q9DCB3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
MNCb-2875Q9DCB3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MNCb-2875Q9DCB3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MNCb-2875Q9DCB3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MNCb-2875Q9DCB3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MNCb-2875Q9DCB3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MNCb-2875Q9DCB3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MNCb-2875Q9DCB3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MNCb-2875Q9DCB3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MNCb-2875Q9DCB3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MNCb-2875Q9DCB3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MNCb-2875Q9DCB3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MNCb-2875Q9DCB3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MNCb-2875Q9DCB3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MNCb-2875Q9DCB3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MNCb-2875Q9DCB3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MNCb-2875Q9DCB3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MNCb-2875Q9DCB3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MNCb-2875Q9DCB3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MNCb-2875Q9DCB3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MNCb-2875Q9DCB3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MNCb-2875Q9DCB3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MNCb-2875Q9DCB3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MNCb-2875Q9DCB3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MNCb-2875Q9DCB3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MNCb-2875Q9DCB3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MNCb-2875Q9DCB3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MNCb-2875Q9DCB3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MNCb-2875Q9DCB3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MNCb-2875Q9DCB3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MNCb-2875Q9DCB3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MNCb-2875Q9DCB3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MNCb-2875Q9DCB3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MNCb-2875Q9DCB3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MNCb-2875Q9DCB3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MNCb-2875Q9DCB3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MNCb-2875Q9DCB3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MNCb-2875Q9DCB3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MNCb-2875Q9DCB3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MNCb-2875Q9DCB3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MNCb-2875Q9DCB3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MNCb-2875Q9DCB3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MNCb-2875Q9DCB3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MNCb-2875Q9DCB3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MNCb-2875Q9DCB3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MNCb-2875Q9DCB3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MNCb-2875Q9DCB3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MNCb-2875Q9DCB3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MNCb-2875Q9DCB3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MNCb-2875Q9DCB3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MNCb-2875Q9DCB3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MNCb-2875Q9DCB3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MNCb-2875Q9DCB3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MNCb-2875Q9DCB3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MNCb-2875Q9DCB3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MNCb-2875Q9DCB3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MNCb-2875Q9DCB3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MNCb-2875Q9DCB3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MNCb-2875Q9DCB3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MNCb-2875Q9DCB3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MNCb-2875Q9DCB3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MNCb-2875Q9DCB3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MNCb-2875Q9DCB3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MNCb-2875Q9DCB3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MNCb-2875Q9DCB3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MNCb-2875Q9DCB3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MNCb-2875Q9DCB3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MNCb-2875Q9DCB3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MNCb-2875Q9DCB3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MNCb-2875Q9DCB3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MNCb-2875Q9DCB3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MNCb-2875Q9DCB3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MNCb-2875Q9DCB3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MNCb-2875Q9DCB3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MNCb-2875Q9DCB3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MNCb-2875Q9DCB3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MNCb-2875Q9DCB3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MNCb-2875Q9DCB3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms