Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpne8Q9DC53 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpne8Q9DC53 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpne8Q9DC53 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpne8Q9DC53 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpne8Q9DC53 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpne8Q9DC53 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpne8Q9DC53 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpne8Q9DC53 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpne8Q9DC53 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cpne8Q9DC53 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cpne8Q9DC53 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpne8Q9DC53 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpne8Q9DC53 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpne8Q9DC53 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpne8Q9DC53 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpne8Q9DC53 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpne8Q9DC53 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpne8Q9DC53 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpne8Q9DC53 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpne8Q9DC53 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpne8Q9DC53 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpne8Q9DC53 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpne8Q9DC53 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpne8Q9DC53 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpne8Q9DC53 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpne8Q9DC53 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpne8Q9DC53 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpne8Q9DC53 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpne8Q9DC53 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpne8Q9DC53 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpne8Q9DC53 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpne8Q9DC53 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpne8Q9DC53 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpne8Q9DC53 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpne8Q9DC53 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpne8Q9DC53 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpne8Q9DC53 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpne8Q9DC53 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpne8Q9DC53 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpne8Q9DC53 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpne8Q9DC53 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpne8Q9DC53 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpne8Q9DC53 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpne8Q9DC53 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpne8Q9DC53 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpne8Q9DC53 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpne8Q9DC53 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpne8Q9DC53 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cpne8Q9DC53 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms