Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fundc1Q9DB70 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fundc1Q9DB70 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fundc1Q9DB70 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fundc1Q9DB70 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fundc1Q9DB70 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fundc1Q9DB70 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fundc1Q9DB70 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fundc1Q9DB70 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fundc1Q9DB70 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fundc1Q9DB70 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fundc1Q9DB70 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fundc1Q9DB70 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fundc1Q9DB70 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fundc1Q9DB70 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fundc1Q9DB70 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fundc1Q9DB70 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Fundc1Q9DB70 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fundc1Q9DB70 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fundc1Q9DB70 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fundc1Q9DB70 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fundc1Q9DB70 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fundc1Q9DB70 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Fundc1Q9DB70 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fundc1Q9DB70 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fundc1Q9DB70 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fundc1Q9DB70 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fundc1Q9DB70 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fundc1Q9DB70 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fundc1Q9DB70 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fundc1Q9DB70 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fundc1Q9DB70 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fundc1Q9DB70 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fundc1Q9DB70 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fundc1Q9DB70 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fundc1Q9DB70 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fundc1Q9DB70 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fundc1Q9DB70 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Fundc1Q9DB70 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fundc1Q9DB70 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fundc1Q9DB70 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fundc1Q9DB70 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fundc1Q9DB70 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fundc1Q9DB70 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fundc1Q9DB70 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fundc1Q9DB70 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fundc1Q9DB70 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fundc1Q9DB70 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fundc1Q9DB70 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fundc1Q9DB70 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fundc1Q9DB70 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fundc1Q9DB70 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fundc1Q9DB70 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fundc1Q9DB70 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fundc1Q9DB70 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fundc1Q9DB70 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fundc1Q9DB70 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fundc1Q9DB70 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fundc1Q9DB70 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fundc1Q9DB70 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fundc1Q9DB70 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fundc1Q9DB70 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fundc1Q9DB70 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fundc1Q9DB70 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fundc1Q9DB70 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fundc1Q9DB70 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fundc1Q9DB70 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fundc1Q9DB70 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fundc1Q9DB70 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fundc1Q9DB70 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fundc1Q9DB70 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fundc1Q9DB70 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fundc1Q9DB70 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fundc1Q9DB70 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fundc1Q9DB70 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fundc1Q9DB70 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Fundc1Q9DB70 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Fundc1Q9DB70 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Fundc1Q9DB70 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fundc1Q9DB70 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fundc1Q9DB70 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fundc1Q9DB70 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fundc1Q9DB70 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Fundc1Q9DB70 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fundc1Q9DB70 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fundc1Q9DB70 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fundc1Q9DB70 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fundc1Q9DB70 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fundc1Q9DB70 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fundc1Q9DB70 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fundc1Q9DB70 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fundc1Q9DB70 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fundc1Q9DB70 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fundc1Q9DB70 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fundc1Q9DB70 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Fundc1Q9DB70 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fundc1Q9DB70 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fundc1Q9DB70 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fundc1Q9DB70 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fundc1Q9DB70 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms