Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB50

Ap1s2, AP-1 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s2Q9DB50 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap1s2Q9DB50 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap1s2Q9DB50 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap1s2Q9DB50 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap1s2Q9DB50 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap1s2Q9DB50 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap1s2Q9DB50 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap1s2Q9DB50 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap1s2Q9DB50 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap1s2Q9DB50 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap1s2Q9DB50 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap1s2Q9DB50 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap1s2Q9DB50 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap1s2Q9DB50 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap1s2Q9DB50 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap1s2Q9DB50 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap1s2Q9DB50 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap1s2Q9DB50 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap1s2Q9DB50 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap1s2Q9DB50 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap1s2Q9DB50 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap1s2Q9DB50 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap1s2Q9DB50 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap1s2Q9DB50 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap1s2Q9DB50 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap1s2Q9DB50 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap1s2Q9DB50 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap1s2Q9DB50 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap1s2Q9DB50 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap1s2Q9DB50 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap1s2Q9DB50 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap1s2Q9DB50 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap1s2Q9DB50 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap1s2Q9DB50 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap1s2Q9DB50 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap1s2Q9DB50 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap1s2Q9DB50 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap1s2Q9DB50 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap1s2Q9DB50 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap1s2Q9DB50 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap1s2Q9DB50 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ap1s2Q9DB50 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms