Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pop5Q9DB28 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pop5Q9DB28 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pop5Q9DB28 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pop5Q9DB28 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pop5Q9DB28 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pop5Q9DB28 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Pop5Q9DB28 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pop5Q9DB28 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pop5Q9DB28 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pop5Q9DB28 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pop5Q9DB28 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pop5Q9DB28 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pop5Q9DB28 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pop5Q9DB28 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pop5Q9DB28 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pop5Q9DB28 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Pop5Q9DB28 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pop5Q9DB28 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pop5Q9DB28 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pop5Q9DB28 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pop5Q9DB28 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pop5Q9DB28 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pop5Q9DB28 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pop5Q9DB28 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pop5Q9DB28 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pop5Q9DB28 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Pop5Q9DB28 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pop5Q9DB28 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pop5Q9DB28 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pop5Q9DB28 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Pop5Q9DB28 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pop5Q9DB28 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pop5Q9DB28 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Pop5Q9DB28 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pop5Q9DB28 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pop5Q9DB28 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pop5Q9DB28 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pop5Q9DB28 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pop5Q9DB28 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pop5Q9DB28 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pop5Q9DB28 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pop5Q9DB28 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pop5Q9DB28 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pop5Q9DB28 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pop5Q9DB28 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pop5Q9DB28 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pop5Q9DB28 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pop5Q9DB28 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pop5Q9DB28 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pop5Q9DB28 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pop5Q9DB28 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pop5Q9DB28 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pop5Q9DB28 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pop5Q9DB28 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pop5Q9DB28 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pop5Q9DB28 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pop5Q9DB28 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pop5Q9DB28 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pop5Q9DB28 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pop5Q9DB28 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pop5Q9DB28 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pop5Q9DB28 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pop5Q9DB28 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pop5Q9DB28 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pop5Q9DB28 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pop5Q9DB28 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pop5Q9DB28 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pop5Q9DB28 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pop5Q9DB28 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pop5Q9DB28 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pop5Q9DB28 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pop5Q9DB28 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pop5Q9DB28 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pop5Q9DB28 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pop5Q9DB28 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pop5Q9DB28 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pop5Q9DB28 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pop5Q9DB28 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pop5Q9DB28 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pop5Q9DB28 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pop5Q9DB28 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pop5Q9DB28 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pop5Q9DB28 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pop5Q9DB28 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pop5Q9DB28 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pop5Q9DB28 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pop5Q9DB28 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pop5Q9DB28 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pop5Q9DB28 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pop5Q9DB28 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pop5Q9DB28 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pop5Q9DB28 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pop5Q9DB28 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pop5Q9DB28 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Pop5Q9DB28 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pop5Q9DB28 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pop5Q9DB28 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pop5Q9DB28 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pop5Q9DB28 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms