Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smim23Q9DAL0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smim23Q9DAL0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smim23Q9DAL0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smim23Q9DAL0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smim23Q9DAL0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smim23Q9DAL0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smim23Q9DAL0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smim23Q9DAL0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smim23Q9DAL0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smim23Q9DAL0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smim23Q9DAL0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smim23Q9DAL0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smim23Q9DAL0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smim23Q9DAL0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smim23Q9DAL0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smim23Q9DAL0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smim23Q9DAL0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smim23Q9DAL0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smim23Q9DAL0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smim23Q9DAL0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smim23Q9DAL0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smim23Q9DAL0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smim23Q9DAL0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smim23Q9DAL0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smim23Q9DAL0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smim23Q9DAL0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smim23Q9DAL0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smim23Q9DAL0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smim23Q9DAL0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smim23Q9DAL0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Smim23Q9DAL0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smim23Q9DAL0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim23Q9DAL0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim23Q9DAL0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim23Q9DAL0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim23Q9DAL0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim23Q9DAL0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim23Q9DAL0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim23Q9DAL0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim23Q9DAL0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim23Q9DAL0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim23Q9DAL0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim23Q9DAL0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smim23Q9DAL0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smim23Q9DAL0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smim23Q9DAL0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Smim23Q9DAL0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smim23Q9DAL0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smim23Q9DAL0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smim23Q9DAL0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smim23Q9DAL0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smim23Q9DAL0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smim23Q9DAL0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smim23Q9DAL0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smim23Q9DAL0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smim23Q9DAL0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Smim23Q9DAL0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Smim23Q9DAL0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Smim23Q9DAL0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smim23Q9DAL0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smim23Q9DAL0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smim23Q9DAL0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smim23Q9DAL0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smim23Q9DAL0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smim23Q9DAL0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smim23Q9DAL0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smim23Q9DAL0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim23Q9DAL0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim23Q9DAL0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim23Q9DAL0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim23Q9DAL0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim23Q9DAL0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim23Q9DAL0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim23Q9DAL0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim23Q9DAL0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim23Q9DAL0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smim23Q9DAL0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Smim23Q9DAL0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smim23Q9DAL0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smim23Q9DAL0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smim23Q9DAL0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smim23Q9DAL0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smim23Q9DAL0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smim23Q9DAL0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smim23Q9DAL0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smim23Q9DAL0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smim23Q9DAL0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smim23Q9DAL0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smim23Q9DAL0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smim23Q9DAL0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smim23Q9DAL0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smim23Q9DAL0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smim23Q9DAL0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smim23Q9DAL0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smim23Q9DAL0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smim23Q9DAL0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smim23Q9DAL0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smim23Q9DAL0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smim23Q9DAL0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms