Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAH2

Znrf4, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF4, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf4Q9DAH2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znrf4Q9DAH2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Znrf4Q9DAH2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znrf4Q9DAH2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znrf4Q9DAH2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znrf4Q9DAH2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Znrf4Q9DAH2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znrf4Q9DAH2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znrf4Q9DAH2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znrf4Q9DAH2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znrf4Q9DAH2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znrf4Q9DAH2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znrf4Q9DAH2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znrf4Q9DAH2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znrf4Q9DAH2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znrf4Q9DAH2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znrf4Q9DAH2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znrf4Q9DAH2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znrf4Q9DAH2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znrf4Q9DAH2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znrf4Q9DAH2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znrf4Q9DAH2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znrf4Q9DAH2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znrf4Q9DAH2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znrf4Q9DAH2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znrf4Q9DAH2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znrf4Q9DAH2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znrf4Q9DAH2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znrf4Q9DAH2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znrf4Q9DAH2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znrf4Q9DAH2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znrf4Q9DAH2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znrf4Q9DAH2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znrf4Q9DAH2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znrf4Q9DAH2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znrf4Q9DAH2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znrf4Q9DAH2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znrf4Q9DAH2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znrf4Q9DAH2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Znrf4Q9DAH2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Znrf4Q9DAH2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znrf4Q9DAH2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znrf4Q9DAH2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Znrf4Q9DAH2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znrf4Q9DAH2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znrf4Q9DAH2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znrf4Q9DAH2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Znrf4Q9DAH2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znrf4Q9DAH2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znrf4Q9DAH2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znrf4Q9DAH2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znrf4Q9DAH2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znrf4Q9DAH2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znrf4Q9DAH2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znrf4Q9DAH2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znrf4Q9DAH2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znrf4Q9DAH2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znrf4Q9DAH2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znrf4Q9DAH2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znrf4Q9DAH2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znrf4Q9DAH2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znrf4Q9DAH2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znrf4Q9DAH2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Znrf4Q9DAH2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znrf4Q9DAH2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znrf4Q9DAH2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Znrf4Q9DAH2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znrf4Q9DAH2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znrf4Q9DAH2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znrf4Q9DAH2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Znrf4Q9DAH2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Znrf4Q9DAH2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Znrf4Q9DAH2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Znrf4Q9DAH2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Znrf4Q9DAH2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Znrf4Q9DAH2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znrf4Q9DAH2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znrf4Q9DAH2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znrf4Q9DAH2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znrf4Q9DAH2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Znrf4Q9DAH2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Znrf4Q9DAH2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znrf4Q9DAH2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znrf4Q9DAH2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znrf4Q9DAH2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znrf4Q9DAH2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znrf4Q9DAH2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znrf4Q9DAH2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znrf4Q9DAH2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Znrf4Q9DAH2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znrf4Q9DAH2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znrf4Q9DAH2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znrf4Q9DAH2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znrf4Q9DAH2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znrf4Q9DAH2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znrf4Q9DAH2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znrf4Q9DAH2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znrf4Q9DAH2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znrf4Q9DAH2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znrf4Q9DAH2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms