Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAE8

UPF0739 protein C1orf74 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAE8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9DAE8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9DAE8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9DAE8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9DAE8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9DAE8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9DAE8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9DAE8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9DAE8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9DAE8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9DAE8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9DAE8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9DAE8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9DAE8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9DAE8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9DAE8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9DAE8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9DAE8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9DAE8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9DAE8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9DAE8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9DAE8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9DAE8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9DAE8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9DAE8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9DAE8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9DAE8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9DAE8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9DAE8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9DAE8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9DAE8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9DAE8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9DAE8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9DAE8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9DAE8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9DAE8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9DAE8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9DAE8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9DAE8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9DAE8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9DAE8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9DAE8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9DAE8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9DAE8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9DAE8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9DAE8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9DAE8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9DAE8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9DAE8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9DAE8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9DAE8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9DAE8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9DAE8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9DAE8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9DAE8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9DAE8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9DAE8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9DAE8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9DAE8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9DAE8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9DAE8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9DAE8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9DAE8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9DAE8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9DAE8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9DAE8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9DAE8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9DAE8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9DAE8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9DAE8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9DAE8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9DAE8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9DAE8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9DAE8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9DAE8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9DAE8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9DAE8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9DAE8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9DAE8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9DAE8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9DAE8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9DAE8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9DAE8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9DAE8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9DAE8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9DAE8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9DAE8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9DAE8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9DAE8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9DAE8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9DAE8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9DAE8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9DAE8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9DAE8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9DAE8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9DAE8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9DAE8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9DAE8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9DAE8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9DAE8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms