Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAA3

Uncharacterized protein C4orf36 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAA3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9DAA3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9DAA3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9DAA3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9DAA3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9DAA3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9DAA3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9DAA3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9DAA3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9DAA3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9DAA3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9DAA3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9DAA3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9DAA3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9DAA3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9DAA3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9DAA3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9DAA3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9DAA3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9DAA3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9DAA3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9DAA3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9DAA3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9DAA3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9DAA3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9DAA3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9DAA3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9DAA3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9DAA3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9DAA3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9DAA3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9DAA3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9DAA3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9DAA3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9DAA3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9DAA3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9DAA3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9DAA3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9DAA3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9DAA3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9DAA3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9DAA3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9DAA3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9DAA3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9DAA3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9DAA3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9DAA3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9DAA3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9DAA3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9DAA3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9DAA3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9DAA3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms