Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg7Q9D906 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg7Q9D906 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg7Q9D906 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg7Q9D906 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg7Q9D906 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg7Q9D906 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg7Q9D906 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg7Q9D906 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg7Q9D906 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg7Q9D906 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg7Q9D906 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg7Q9D906 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg7Q9D906 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg7Q9D906 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg7Q9D906 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg7Q9D906 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg7Q9D906 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg7Q9D906 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg7Q9D906 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg7Q9D906 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg7Q9D906 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg7Q9D906 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg7Q9D906 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atg7Q9D906 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg7Q9D906 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg7Q9D906 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg7Q9D906 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg7Q9D906 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg7Q9D906 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg7Q9D906 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg7Q9D906 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg7Q9D906 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg7Q9D906 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg7Q9D906 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg7Q9D906 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg7Q9D906 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg7Q9D906 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg7Q9D906 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg7Q9D906 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg7Q9D906 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg7Q9D906 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg7Q9D906 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg7Q9D906 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg7Q9D906 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg7Q9D906 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg7Q9D906 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg7Q9D906 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg7Q9D906 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg7Q9D906 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg7Q9D906 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg7Q9D906 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg7Q9D906 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg7Q9D906 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg7Q9D906 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg7Q9D906 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg7Q9D906 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg7Q9D906 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg7Q9D906 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg7Q9D906 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg7Q9D906 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg7Q9D906 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg7Q9D906 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg7Q9D906 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg7Q9D906 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg7Q9D906 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg7Q9D906 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg7Q9D906 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg7Q9D906 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg7Q9D906 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg7Q9D906 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg7Q9D906 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg7Q9D906 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg7Q9D906 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg7Q9D906 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg7Q9D906 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg7Q9D906 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg7Q9D906 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg7Q9D906 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg7Q9D906 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg7Q9D906 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg7Q9D906 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg7Q9D906 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg7Q9D906 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg7Q9D906 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg7Q9D906 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg7Q9D906 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg7Q9D906 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg7Q9D906 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg7Q9D906 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Atg7Q9D906 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg7Q9D906 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg7Q9D906 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg7Q9D906 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg7Q9D906 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg7Q9D906 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg7Q9D906 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg7Q9D906 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg7Q9D906 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg7Q9D906 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms