Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T0

Fam3a, Protein FAM3A, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3aQ9D8T0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam3aQ9D8T0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam3aQ9D8T0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam3aQ9D8T0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam3aQ9D8T0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam3aQ9D8T0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam3aQ9D8T0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam3aQ9D8T0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam3aQ9D8T0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam3aQ9D8T0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam3aQ9D8T0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam3aQ9D8T0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam3aQ9D8T0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam3aQ9D8T0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam3aQ9D8T0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam3aQ9D8T0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam3aQ9D8T0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam3aQ9D8T0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam3aQ9D8T0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam3aQ9D8T0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam3aQ9D8T0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam3aQ9D8T0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam3aQ9D8T0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam3aQ9D8T0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam3aQ9D8T0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam3aQ9D8T0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam3aQ9D8T0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam3aQ9D8T0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam3aQ9D8T0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam3aQ9D8T0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam3aQ9D8T0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam3aQ9D8T0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam3aQ9D8T0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam3aQ9D8T0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam3aQ9D8T0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam3aQ9D8T0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam3aQ9D8T0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam3aQ9D8T0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam3aQ9D8T0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam3aQ9D8T0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam3aQ9D8T0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam3aQ9D8T0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam3aQ9D8T0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam3aQ9D8T0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam3aQ9D8T0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam3aQ9D8T0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam3aQ9D8T0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam3aQ9D8T0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam3aQ9D8T0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam3aQ9D8T0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam3aQ9D8T0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam3aQ9D8T0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam3aQ9D8T0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam3aQ9D8T0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam3aQ9D8T0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam3aQ9D8T0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam3aQ9D8T0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam3aQ9D8T0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam3aQ9D8T0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam3aQ9D8T0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam3aQ9D8T0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam3aQ9D8T0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms