Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rexo2Q9D8S4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rexo2Q9D8S4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rexo2Q9D8S4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rexo2Q9D8S4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rexo2Q9D8S4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rexo2Q9D8S4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rexo2Q9D8S4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rexo2Q9D8S4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rexo2Q9D8S4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rexo2Q9D8S4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rexo2Q9D8S4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rexo2Q9D8S4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rexo2Q9D8S4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rexo2Q9D8S4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rexo2Q9D8S4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rexo2Q9D8S4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rexo2Q9D8S4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rexo2Q9D8S4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rexo2Q9D8S4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rexo2Q9D8S4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rexo2Q9D8S4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rexo2Q9D8S4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rexo2Q9D8S4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rexo2Q9D8S4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rexo2Q9D8S4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rexo2Q9D8S4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rexo2Q9D8S4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rexo2Q9D8S4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rexo2Q9D8S4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rexo2Q9D8S4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rexo2Q9D8S4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rexo2Q9D8S4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rexo2Q9D8S4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rexo2Q9D8S4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rexo2Q9D8S4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rexo2Q9D8S4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rexo2Q9D8S4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rexo2Q9D8S4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rexo2Q9D8S4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rexo2Q9D8S4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rexo2Q9D8S4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rexo2Q9D8S4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rexo2Q9D8S4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rexo2Q9D8S4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rexo2Q9D8S4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rexo2Q9D8S4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rexo2Q9D8S4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rexo2Q9D8S4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rexo2Q9D8S4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rexo2Q9D8S4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rexo2Q9D8S4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rexo2Q9D8S4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rexo2Q9D8S4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rexo2Q9D8S4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rexo2Q9D8S4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rexo2Q9D8S4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rexo2Q9D8S4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rexo2Q9D8S4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rexo2Q9D8S4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rexo2Q9D8S4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rexo2Q9D8S4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rexo2Q9D8S4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rexo2Q9D8S4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rexo2Q9D8S4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rexo2Q9D8S4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rexo2Q9D8S4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rexo2Q9D8S4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rexo2Q9D8S4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rexo2Q9D8S4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rexo2Q9D8S4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rexo2Q9D8S4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rexo2Q9D8S4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rexo2Q9D8S4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rexo2Q9D8S4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rexo2Q9D8S4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rexo2Q9D8S4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rexo2Q9D8S4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rexo2Q9D8S4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rexo2Q9D8S4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rexo2Q9D8S4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rexo2Q9D8S4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rexo2Q9D8S4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rexo2Q9D8S4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rexo2Q9D8S4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rexo2Q9D8S4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rexo2Q9D8S4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rexo2Q9D8S4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rexo2Q9D8S4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rexo2Q9D8S4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rexo2Q9D8S4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rexo2Q9D8S4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rexo2Q9D8S4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rexo2Q9D8S4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rexo2Q9D8S4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rexo2Q9D8S4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rexo2Q9D8S4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rexo2Q9D8S4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rexo2Q9D8S4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rexo2Q9D8S4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms