Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ifi35Q9D8C4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ifi35Q9D8C4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ifi35Q9D8C4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ifi35Q9D8C4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ifi35Q9D8C4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ifi35Q9D8C4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ifi35Q9D8C4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ifi35Q9D8C4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ifi35Q9D8C4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ifi35Q9D8C4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ifi35Q9D8C4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ifi35Q9D8C4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ifi35Q9D8C4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ifi35Q9D8C4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ifi35Q9D8C4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ifi35Q9D8C4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ifi35Q9D8C4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Ifi35Q9D8C4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifi35Q9D8C4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifi35Q9D8C4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifi35Q9D8C4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifi35Q9D8C4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifi35Q9D8C4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifi35Q9D8C4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifi35Q9D8C4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifi35Q9D8C4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifi35Q9D8C4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifi35Q9D8C4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifi35Q9D8C4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifi35Q9D8C4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifi35Q9D8C4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifi35Q9D8C4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifi35Q9D8C4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifi35Q9D8C4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifi35Q9D8C4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ifi35Q9D8C4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ifi35Q9D8C4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ifi35Q9D8C4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ifi35Q9D8C4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ifi35Q9D8C4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ifi35Q9D8C4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ifi35Q9D8C4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ifi35Q9D8C4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ifi35Q9D8C4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ifi35Q9D8C4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ifi35Q9D8C4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ifi35Q9D8C4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ifi35Q9D8C4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ifi35Q9D8C4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ifi35Q9D8C4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ifi35Q9D8C4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ifi35Q9D8C4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ifi35Q9D8C4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ifi35Q9D8C4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ifi35Q9D8C4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ifi35Q9D8C4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ifi35Q9D8C4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ifi35Q9D8C4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ifi35Q9D8C4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ifi35Q9D8C4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ifi35Q9D8C4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ifi35Q9D8C4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ifi35Q9D8C4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ifi35Q9D8C4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ifi35Q9D8C4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ifi35Q9D8C4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ifi35Q9D8C4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ifi35Q9D8C4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ifi35Q9D8C4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ifi35Q9D8C4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ifi35Q9D8C4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ifi35Q9D8C4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ifi35Q9D8C4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ifi35Q9D8C4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ifi35Q9D8C4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ifi35Q9D8C4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ifi35Q9D8C4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ifi35Q9D8C4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ifi35Q9D8C4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ifi35Q9D8C4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ifi35Q9D8C4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ifi35Q9D8C4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ifi35Q9D8C4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ifi35Q9D8C4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ifi35Q9D8C4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ifi35Q9D8C4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ifi35Q9D8C4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ifi35Q9D8C4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ifi35Q9D8C4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ifi35Q9D8C4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ifi35Q9D8C4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ifi35Q9D8C4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ifi35Q9D8C4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ifi35Q9D8C4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ifi35Q9D8C4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ifi35Q9D8C4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ifi35Q9D8C4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ifi35Q9D8C4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ifi35Q9D8C4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
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