Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn23Q9D7D7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn23Q9D7D7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn23Q9D7D7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn23Q9D7D7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn23Q9D7D7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn23Q9D7D7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn23Q9D7D7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn23Q9D7D7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn23Q9D7D7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn23Q9D7D7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn23Q9D7D7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn23Q9D7D7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn23Q9D7D7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn23Q9D7D7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn23Q9D7D7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn23Q9D7D7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn23Q9D7D7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn23Q9D7D7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn23Q9D7D7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn23Q9D7D7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn23Q9D7D7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn23Q9D7D7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn23Q9D7D7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn23Q9D7D7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn23Q9D7D7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn23Q9D7D7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn23Q9D7D7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn23Q9D7D7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn23Q9D7D7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn23Q9D7D7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn23Q9D7D7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn23Q9D7D7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn23Q9D7D7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn23Q9D7D7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn23Q9D7D7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn23Q9D7D7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn23Q9D7D7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn23Q9D7D7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn23Q9D7D7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn23Q9D7D7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn23Q9D7D7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn23Q9D7D7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn23Q9D7D7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn23Q9D7D7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn23Q9D7D7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn23Q9D7D7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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