Protein–RNA interactions for Protein: Q9D727

Uncharacterized protein C6orf226 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D727 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D727 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D727 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D727 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D727 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D727 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D727 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D727 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D727 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D727 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D727 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D727 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D727 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D727 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D727 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D727 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D727 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D727 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D727 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D727 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D727 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D727 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D727 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D727 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D727 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D727 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D727 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D727 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D727 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D727 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D727 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D727 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D727 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D727 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D727 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D727 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D727 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D727 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D727 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D727 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D727 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D727 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D727 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D727 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D727 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D727 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D727 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D727 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D727 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D727 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D727 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D727 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D727 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D727 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D727 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D727 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D727 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D727 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D727 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D727 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D727 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D727 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D727 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D727 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D727 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D727 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D727 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D727 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D727 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D727 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D727 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D727 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D727 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D727 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D727 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D727 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D727 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D727 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D727 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D727 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D727 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D727 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D727 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D727 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D727 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D727 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D727 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9D727 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9D727 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D727 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D727 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D727 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D727 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D727 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D727 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D727 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D727 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D727 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D727 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D727 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms