Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y4

Borcs8, BLOC-1-related complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs8Q9D6Y4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Borcs8Q9D6Y4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Borcs8Q9D6Y4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Borcs8Q9D6Y4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Borcs8Q9D6Y4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Borcs8Q9D6Y4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Borcs8Q9D6Y4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Borcs8Q9D6Y4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Borcs8Q9D6Y4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Borcs8Q9D6Y4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Borcs8Q9D6Y4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Borcs8Q9D6Y4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Borcs8Q9D6Y4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Borcs8Q9D6Y4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Borcs8Q9D6Y4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Borcs8Q9D6Y4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Borcs8Q9D6Y4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Borcs8Q9D6Y4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Borcs8Q9D6Y4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Borcs8Q9D6Y4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Borcs8Q9D6Y4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Borcs8Q9D6Y4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Borcs8Q9D6Y4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Borcs8Q9D6Y4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Borcs8Q9D6Y4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Borcs8Q9D6Y4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Borcs8Q9D6Y4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Borcs8Q9D6Y4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Borcs8Q9D6Y4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Borcs8Q9D6Y4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms