Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubb4aQ9D6F9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tubb4aQ9D6F9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tubb4aQ9D6F9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tubb4aQ9D6F9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tubb4aQ9D6F9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tubb4aQ9D6F9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubb4aQ9D6F9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubb4aQ9D6F9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubb4aQ9D6F9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubb4aQ9D6F9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubb4aQ9D6F9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubb4aQ9D6F9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubb4aQ9D6F9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubb4aQ9D6F9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubb4aQ9D6F9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubb4aQ9D6F9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubb4aQ9D6F9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubb4aQ9D6F9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubb4aQ9D6F9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb4aQ9D6F9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb4aQ9D6F9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb4aQ9D6F9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb4aQ9D6F9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb4aQ9D6F9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb4aQ9D6F9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb4aQ9D6F9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb4aQ9D6F9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubb4aQ9D6F9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubb4aQ9D6F9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubb4aQ9D6F9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubb4aQ9D6F9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubb4aQ9D6F9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubb4aQ9D6F9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubb4aQ9D6F9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubb4aQ9D6F9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubb4aQ9D6F9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubb4aQ9D6F9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubb4aQ9D6F9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubb4aQ9D6F9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubb4aQ9D6F9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubb4aQ9D6F9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubb4aQ9D6F9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubb4aQ9D6F9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubb4aQ9D6F9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubb4aQ9D6F9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubb4aQ9D6F9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubb4aQ9D6F9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms