Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W6

Slco6d1, MCG6225, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco6d1Q9D5W6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Slco6d1Q9D5W6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slco6d1Q9D5W6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slco6d1Q9D5W6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slco6d1Q9D5W6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slco6d1Q9D5W6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slco6d1Q9D5W6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slco6d1Q9D5W6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slco6d1Q9D5W6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slco6d1Q9D5W6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slco6d1Q9D5W6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slco6d1Q9D5W6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slco6d1Q9D5W6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slco6d1Q9D5W6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slco6d1Q9D5W6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slco6d1Q9D5W6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slco6d1Q9D5W6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slco6d1Q9D5W6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Slco6d1Q9D5W6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Slco6d1Q9D5W6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slco6d1Q9D5W6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slco6d1Q9D5W6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slco6d1Q9D5W6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slco6d1Q9D5W6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slco6d1Q9D5W6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slco6d1Q9D5W6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slco6d1Q9D5W6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slco6d1Q9D5W6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slco6d1Q9D5W6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slco6d1Q9D5W6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slco6d1Q9D5W6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slco6d1Q9D5W6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slco6d1Q9D5W6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slco6d1Q9D5W6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slco6d1Q9D5W6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Slco6d1Q9D5W6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slco6d1Q9D5W6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slco6d1Q9D5W6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slco6d1Q9D5W6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slco6d1Q9D5W6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slco6d1Q9D5W6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slco6d1Q9D5W6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slco6d1Q9D5W6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slco6d1Q9D5W6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slco6d1Q9D5W6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slco6d1Q9D5W6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slco6d1Q9D5W6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slco6d1Q9D5W6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slco6d1Q9D5W6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slco6d1Q9D5W6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Slco6d1Q9D5W6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slco6d1Q9D5W6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slco6d1Q9D5W6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slco6d1Q9D5W6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slco6d1Q9D5W6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slco6d1Q9D5W6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slco6d1Q9D5W6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slco6d1Q9D5W6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slco6d1Q9D5W6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slco6d1Q9D5W6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slco6d1Q9D5W6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slco6d1Q9D5W6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slco6d1Q9D5W6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slco6d1Q9D5W6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slco6d1Q9D5W6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Slco6d1Q9D5W6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slco6d1Q9D5W6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slco6d1Q9D5W6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slco6d1Q9D5W6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slco6d1Q9D5W6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Slco6d1Q9D5W6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slco6d1Q9D5W6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slco6d1Q9D5W6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slco6d1Q9D5W6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slco6d1Q9D5W6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slco6d1Q9D5W6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slco6d1Q9D5W6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slco6d1Q9D5W6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slco6d1Q9D5W6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slco6d1Q9D5W6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slco6d1Q9D5W6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slco6d1Q9D5W6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slco6d1Q9D5W6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slco6d1Q9D5W6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slco6d1Q9D5W6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slco6d1Q9D5W6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slco6d1Q9D5W6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slco6d1Q9D5W6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slco6d1Q9D5W6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Slco6d1Q9D5W6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Slco6d1Q9D5W6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slco6d1Q9D5W6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slco6d1Q9D5W6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slco6d1Q9D5W6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slco6d1Q9D5W6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slco6d1Q9D5W6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slco6d1Q9D5W6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slco6d1Q9D5W6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slco6d1Q9D5W6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slco6d1Q9D5W6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms