Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc81Q9D5W4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc81Q9D5W4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc81Q9D5W4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc81Q9D5W4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc81Q9D5W4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc81Q9D5W4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc81Q9D5W4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc81Q9D5W4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc81Q9D5W4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc81Q9D5W4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc81Q9D5W4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc81Q9D5W4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc81Q9D5W4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc81Q9D5W4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc81Q9D5W4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc81Q9D5W4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc81Q9D5W4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc81Q9D5W4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc81Q9D5W4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc81Q9D5W4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc81Q9D5W4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc81Q9D5W4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc81Q9D5W4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc81Q9D5W4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc81Q9D5W4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc81Q9D5W4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc81Q9D5W4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc81Q9D5W4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc81Q9D5W4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc81Q9D5W4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc81Q9D5W4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc81Q9D5W4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc81Q9D5W4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc81Q9D5W4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc81Q9D5W4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc81Q9D5W4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc81Q9D5W4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc81Q9D5W4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc81Q9D5W4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc81Q9D5W4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc81Q9D5W4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc81Q9D5W4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc81Q9D5W4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc81Q9D5W4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc81Q9D5W4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc81Q9D5W4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc81Q9D5W4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc81Q9D5W4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc81Q9D5W4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc81Q9D5W4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc81Q9D5W4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc81Q9D5W4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc81Q9D5W4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc81Q9D5W4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc81Q9D5W4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc81Q9D5W4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc81Q9D5W4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc81Q9D5W4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc81Q9D5W4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc81Q9D5W4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc81Q9D5W4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc81Q9D5W4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc81Q9D5W4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc81Q9D5W4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc81Q9D5W4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc81Q9D5W4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc81Q9D5W4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc81Q9D5W4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc81Q9D5W4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc81Q9D5W4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc81Q9D5W4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc81Q9D5W4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc81Q9D5W4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc81Q9D5W4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc81Q9D5W4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc81Q9D5W4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc81Q9D5W4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc81Q9D5W4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc81Q9D5W4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc81Q9D5W4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc81Q9D5W4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc81Q9D5W4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc81Q9D5W4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc81Q9D5W4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc81Q9D5W4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc81Q9D5W4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc81Q9D5W4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc81Q9D5W4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc81Q9D5W4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc81Q9D5W4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc81Q9D5W4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc81Q9D5W4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc81Q9D5W4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc81Q9D5W4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc81Q9D5W4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms