Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PudpQ9D5U5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PudpQ9D5U5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PudpQ9D5U5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms