Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc130Q9D516 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc130Q9D516 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc130Q9D516 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc130Q9D516 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc130Q9D516 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc130Q9D516 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc130Q9D516 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc130Q9D516 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc130Q9D516 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc130Q9D516 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc130Q9D516 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc130Q9D516 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc130Q9D516 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc130Q9D516 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc130Q9D516 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc130Q9D516 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc130Q9D516 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc130Q9D516 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc130Q9D516 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc130Q9D516 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc130Q9D516 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc130Q9D516 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc130Q9D516 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc130Q9D516 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc130Q9D516 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc130Q9D516 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc130Q9D516 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc130Q9D516 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc130Q9D516 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc130Q9D516 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc130Q9D516 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc130Q9D516 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc130Q9D516 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc130Q9D516 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc130Q9D516 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc130Q9D516 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc130Q9D516 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc130Q9D516 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc130Q9D516 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc130Q9D516 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc130Q9D516 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc130Q9D516 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc130Q9D516 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc130Q9D516 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc130Q9D516 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc130Q9D516 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc130Q9D516 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc130Q9D516 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc130Q9D516 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc130Q9D516 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc130Q9D516 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc130Q9D516 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc130Q9D516 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc130Q9D516 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc130Q9D516 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc130Q9D516 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc130Q9D516 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc130Q9D516 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc130Q9D516 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc130Q9D516 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc130Q9D516 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc130Q9D516 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc130Q9D516 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc130Q9D516 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc130Q9D516 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc130Q9D516 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc130Q9D516 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc130Q9D516 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc130Q9D516 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc130Q9D516 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc130Q9D516 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc130Q9D516 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc130Q9D516 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc130Q9D516 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc130Q9D516 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc130Q9D516 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc130Q9D516 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc130Q9D516 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc130Q9D516 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc130Q9D516 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc130Q9D516 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc130Q9D516 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc130Q9D516 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc130Q9D516 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc130Q9D516 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc130Q9D516 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc130Q9D516 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc130Q9D516 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc130Q9D516 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc130Q9D516 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc130Q9D516 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc130Q9D516 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc130Q9D516 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc130Q9D516 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc130Q9D516 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc130Q9D516 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc130Q9D516 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc130Q9D516 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc130Q9D516 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms