Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3404Q9D506 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3404Q9D506 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3404Q9D506 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3404Q9D506 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3404Q9D506 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3404Q9D506 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3404Q9D506 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3404Q9D506 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3404Q9D506 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3404Q9D506 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3404Q9D506 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3404Q9D506 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3404Q9D506 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3404Q9D506 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3404Q9D506 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3404Q9D506 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3404Q9D506 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3404Q9D506 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3404Q9D506 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3404Q9D506 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3404Q9D506 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3404Q9D506 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3404Q9D506 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3404Q9D506 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3404Q9D506 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3404Q9D506 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3404Q9D506 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3404Q9D506 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3404Q9D506 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3404Q9D506 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3404Q9D506 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3404Q9D506 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm3404Q9D506 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm3404Q9D506 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3404Q9D506 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3404Q9D506 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3404Q9D506 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3404Q9D506 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3404Q9D506 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3404Q9D506 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3404Q9D506 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3404Q9D506 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3404Q9D506 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3404Q9D506 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3404Q9D506 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3404Q9D506 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3404Q9D506 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3404Q9D506 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3404Q9D506 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3404Q9D506 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3404Q9D506 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3404Q9D506 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3404Q9D506 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3404Q9D506 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3404Q9D506 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3404Q9D506 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3404Q9D506 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3404Q9D506 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3404Q9D506 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3404Q9D506 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3404Q9D506 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3404Q9D506 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3404Q9D506 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3404Q9D506 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3404Q9D506 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3404Q9D506 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3404Q9D506 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3404Q9D506 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3404Q9D506 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3404Q9D506 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3404Q9D506 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3404Q9D506 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3404Q9D506 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3404Q9D506 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3404Q9D506 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3404Q9D506 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3404Q9D506 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3404Q9D506 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3404Q9D506 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm3404Q9D506 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3404Q9D506 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3404Q9D506 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3404Q9D506 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3404Q9D506 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3404Q9D506 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3404Q9D506 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3404Q9D506 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3404Q9D506 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3404Q9D506 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3404Q9D506 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3404Q9D506 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3404Q9D506 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3404Q9D506 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3404Q9D506 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3404Q9D506 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3404Q9D506 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3404Q9D506 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3404Q9D506 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3404Q9D506 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms