Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrameQ9D4Z5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrameQ9D4Z5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrameQ9D4Z5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrameQ9D4Z5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PrameQ9D4Z5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrameQ9D4Z5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrameQ9D4Z5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrameQ9D4Z5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrameQ9D4Z5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrameQ9D4Z5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrameQ9D4Z5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrameQ9D4Z5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrameQ9D4Z5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrameQ9D4Z5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrameQ9D4Z5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrameQ9D4Z5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrameQ9D4Z5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrameQ9D4Z5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrameQ9D4Z5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrameQ9D4Z5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrameQ9D4Z5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrameQ9D4Z5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrameQ9D4Z5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrameQ9D4Z5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrameQ9D4Z5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrameQ9D4Z5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrameQ9D4Z5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrameQ9D4Z5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrameQ9D4Z5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrameQ9D4Z5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrameQ9D4Z5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrameQ9D4Z5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrameQ9D4Z5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrameQ9D4Z5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrameQ9D4Z5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrameQ9D4Z5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrameQ9D4Z5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrameQ9D4Z5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrameQ9D4Z5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrameQ9D4Z5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrameQ9D4Z5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrameQ9D4Z5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrameQ9D4Z5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrameQ9D4Z5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrameQ9D4Z5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrameQ9D4Z5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PrameQ9D4Z5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrameQ9D4Z5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrameQ9D4Z5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrameQ9D4Z5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrameQ9D4Z5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrameQ9D4Z5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrameQ9D4Z5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrameQ9D4Z5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrameQ9D4Z5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrameQ9D4Z5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrameQ9D4Z5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrameQ9D4Z5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrameQ9D4Z5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrameQ9D4Z5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrameQ9D4Z5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrameQ9D4Z5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrameQ9D4Z5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrameQ9D4Z5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrameQ9D4Z5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrameQ9D4Z5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrameQ9D4Z5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrameQ9D4Z5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrameQ9D4Z5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrameQ9D4Z5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrameQ9D4Z5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrameQ9D4Z5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrameQ9D4Z5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrameQ9D4Z5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrameQ9D4Z5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PrameQ9D4Z5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrameQ9D4Z5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrameQ9D4Z5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrameQ9D4Z5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PrameQ9D4Z5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrameQ9D4Z5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrameQ9D4Z5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrameQ9D4Z5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PrameQ9D4Z5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PrameQ9D4Z5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PrameQ9D4Z5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrameQ9D4Z5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrameQ9D4Z5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrameQ9D4Z5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrameQ9D4Z5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrameQ9D4Z5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrameQ9D4Z5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrameQ9D4Z5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrameQ9D4Z5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrameQ9D4Z5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrameQ9D4Z5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrameQ9D4Z5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrameQ9D4Z5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrameQ9D4Z5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms