Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gcc1Q9D4H2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gcc1Q9D4H2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gcc1Q9D4H2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gcc1Q9D4H2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gcc1Q9D4H2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Gcc1Q9D4H2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gcc1Q9D4H2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gcc1Q9D4H2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gcc1Q9D4H2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gcc1Q9D4H2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gcc1Q9D4H2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Gcc1Q9D4H2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gcc1Q9D4H2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gcc1Q9D4H2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gcc1Q9D4H2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Gcc1Q9D4H2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gcc1Q9D4H2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Gcc1Q9D4H2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gcc1Q9D4H2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gcc1Q9D4H2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gcc1Q9D4H2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gcc1Q9D4H2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Gcc1Q9D4H2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gcc1Q9D4H2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gcc1Q9D4H2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gcc1Q9D4H2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gcc1Q9D4H2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gcc1Q9D4H2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gcc1Q9D4H2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Gcc1Q9D4H2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gcc1Q9D4H2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gcc1Q9D4H2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gcc1Q9D4H2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gcc1Q9D4H2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gcc1Q9D4H2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gcc1Q9D4H2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gcc1Q9D4H2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gcc1Q9D4H2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Gcc1Q9D4H2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Gcc1Q9D4H2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gcc1Q9D4H2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gcc1Q9D4H2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gcc1Q9D4H2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gcc1Q9D4H2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gcc1Q9D4H2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gcc1Q9D4H2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gcc1Q9D4H2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gcc1Q9D4H2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Gcc1Q9D4H2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gcc1Q9D4H2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gcc1Q9D4H2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gcc1Q9D4H2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gcc1Q9D4H2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gcc1Q9D4H2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gcc1Q9D4H2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gcc1Q9D4H2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gcc1Q9D4H2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gcc1Q9D4H2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gcc1Q9D4H2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gcc1Q9D4H2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gcc1Q9D4H2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gcc1Q9D4H2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gcc1Q9D4H2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gcc1Q9D4H2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gcc1Q9D4H2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gcc1Q9D4H2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gcc1Q9D4H2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gcc1Q9D4H2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gcc1Q9D4H2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gcc1Q9D4H2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gcc1Q9D4H2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gcc1Q9D4H2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gcc1Q9D4H2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gcc1Q9D4H2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gcc1Q9D4H2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gcc1Q9D4H2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gcc1Q9D4H2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gcc1Q9D4H2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Gcc1Q9D4H2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gcc1Q9D4H2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gcc1Q9D4H2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gcc1Q9D4H2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gcc1Q9D4H2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gcc1Q9D4H2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gcc1Q9D4H2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gcc1Q9D4H2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gcc1Q9D4H2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gcc1Q9D4H2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gcc1Q9D4H2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gcc1Q9D4H2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gcc1Q9D4H2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gcc1Q9D4H2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gcc1Q9D4H2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gcc1Q9D4H2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gcc1Q9D4H2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gcc1Q9D4H2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gcc1Q9D4H2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gcc1Q9D4H2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gcc1Q9D4H2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms