Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Syce1Q9D495 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Syce1Q9D495 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Syce1Q9D495 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Syce1Q9D495 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Syce1Q9D495 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syce1Q9D495 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syce1Q9D495 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syce1Q9D495 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syce1Q9D495 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syce1Q9D495 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syce1Q9D495 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Syce1Q9D495 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syce1Q9D495 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syce1Q9D495 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syce1Q9D495 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syce1Q9D495 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Syce1Q9D495 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Syce1Q9D495 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Syce1Q9D495 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syce1Q9D495 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syce1Q9D495 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syce1Q9D495 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Syce1Q9D495 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Syce1Q9D495 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syce1Q9D495 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syce1Q9D495 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syce1Q9D495 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syce1Q9D495 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syce1Q9D495 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syce1Q9D495 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syce1Q9D495 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syce1Q9D495 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syce1Q9D495 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Syce1Q9D495 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Syce1Q9D495 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Syce1Q9D495 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Syce1Q9D495 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Syce1Q9D495 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Syce1Q9D495 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Syce1Q9D495 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syce1Q9D495 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syce1Q9D495 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syce1Q9D495 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syce1Q9D495 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syce1Q9D495 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syce1Q9D495 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syce1Q9D495 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syce1Q9D495 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syce1Q9D495 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syce1Q9D495 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syce1Q9D495 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syce1Q9D495 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syce1Q9D495 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syce1Q9D495 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syce1Q9D495 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syce1Q9D495 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syce1Q9D495 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syce1Q9D495 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syce1Q9D495 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syce1Q9D495 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syce1Q9D495 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syce1Q9D495 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syce1Q9D495 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syce1Q9D495 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syce1Q9D495 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syce1Q9D495 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Syce1Q9D495 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Syce1Q9D495 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Syce1Q9D495 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Syce1Q9D495 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syce1Q9D495 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syce1Q9D495 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syce1Q9D495 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syce1Q9D495 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syce1Q9D495 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syce1Q9D495 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syce1Q9D495 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syce1Q9D495 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syce1Q9D495 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syce1Q9D495 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syce1Q9D495 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syce1Q9D495 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syce1Q9D495 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syce1Q9D495 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syce1Q9D495 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syce1Q9D495 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syce1Q9D495 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syce1Q9D495 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syce1Q9D495 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syce1Q9D495 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syce1Q9D495 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syce1Q9D495 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syce1Q9D495 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Syce1Q9D495 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Syce1Q9D495 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Syce1Q9D495 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Syce1Q9D495 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Syce1Q9D495 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Syce1Q9D495 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms