Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pus10Q9D3U0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pus10Q9D3U0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pus10Q9D3U0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pus10Q9D3U0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pus10Q9D3U0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pus10Q9D3U0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pus10Q9D3U0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pus10Q9D3U0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pus10Q9D3U0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pus10Q9D3U0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pus10Q9D3U0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pus10Q9D3U0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pus10Q9D3U0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pus10Q9D3U0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pus10Q9D3U0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pus10Q9D3U0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pus10Q9D3U0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pus10Q9D3U0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pus10Q9D3U0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pus10Q9D3U0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pus10Q9D3U0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pus10Q9D3U0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pus10Q9D3U0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pus10Q9D3U0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pus10Q9D3U0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pus10Q9D3U0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pus10Q9D3U0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pus10Q9D3U0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pus10Q9D3U0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pus10Q9D3U0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pus10Q9D3U0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pus10Q9D3U0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pus10Q9D3U0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pus10Q9D3U0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pus10Q9D3U0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pus10Q9D3U0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pus10Q9D3U0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pus10Q9D3U0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pus10Q9D3U0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pus10Q9D3U0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pus10Q9D3U0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pus10Q9D3U0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pus10Q9D3U0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pus10Q9D3U0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pus10Q9D3U0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pus10Q9D3U0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pus10Q9D3U0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pus10Q9D3U0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pus10Q9D3U0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pus10Q9D3U0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pus10Q9D3U0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pus10Q9D3U0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pus10Q9D3U0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pus10Q9D3U0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pus10Q9D3U0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pus10Q9D3U0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pus10Q9D3U0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pus10Q9D3U0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pus10Q9D3U0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pus10Q9D3U0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pus10Q9D3U0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pus10Q9D3U0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pus10Q9D3U0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pus10Q9D3U0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pus10Q9D3U0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pus10Q9D3U0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pus10Q9D3U0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pus10Q9D3U0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pus10Q9D3U0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pus10Q9D3U0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pus10Q9D3U0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pus10Q9D3U0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pus10Q9D3U0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pus10Q9D3U0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pus10Q9D3U0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pus10Q9D3U0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pus10Q9D3U0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pus10Q9D3U0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pus10Q9D3U0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pus10Q9D3U0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms