Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3T1

4933436I01Rik, RIKEN cDNA 4933436I01, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933436I01RikQ9D3T1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933436I01RikQ9D3T1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933436I01RikQ9D3T1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933436I01RikQ9D3T1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933436I01RikQ9D3T1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933436I01RikQ9D3T1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933436I01RikQ9D3T1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
4933436I01RikQ9D3T1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
4933436I01RikQ9D3T1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
4933436I01RikQ9D3T1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
4933436I01RikQ9D3T1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4933436I01RikQ9D3T1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4933436I01RikQ9D3T1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4933436I01RikQ9D3T1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4933436I01RikQ9D3T1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
4933436I01RikQ9D3T1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4933436I01RikQ9D3T1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4933436I01RikQ9D3T1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4933436I01RikQ9D3T1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4933436I01RikQ9D3T1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4933436I01RikQ9D3T1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
4933436I01RikQ9D3T1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4933436I01RikQ9D3T1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4933436I01RikQ9D3T1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4933436I01RikQ9D3T1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4933436I01RikQ9D3T1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4933436I01RikQ9D3T1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4933436I01RikQ9D3T1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4933436I01RikQ9D3T1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4933436I01RikQ9D3T1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4933436I01RikQ9D3T1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4933436I01RikQ9D3T1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4933436I01RikQ9D3T1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4933436I01RikQ9D3T1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4933436I01RikQ9D3T1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4933436I01RikQ9D3T1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4933436I01RikQ9D3T1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4933436I01RikQ9D3T1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4933436I01RikQ9D3T1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4933436I01RikQ9D3T1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4933436I01RikQ9D3T1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms