Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Stag1Q9D3E6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Stag1Q9D3E6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Stag1Q9D3E6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Stag1Q9D3E6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Stag1Q9D3E6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Stag1Q9D3E6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Stag1Q9D3E6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Stag1Q9D3E6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Stag1Q9D3E6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Stag1Q9D3E6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Stag1Q9D3E6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Stag1Q9D3E6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Stag1Q9D3E6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Stag1Q9D3E6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Stag1Q9D3E6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Stag1Q9D3E6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Stag1Q9D3E6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Stag1Q9D3E6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Stag1Q9D3E6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Stag1Q9D3E6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Stag1Q9D3E6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Stag1Q9D3E6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Stag1Q9D3E6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stag1Q9D3E6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stag1Q9D3E6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Stag1Q9D3E6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stag1Q9D3E6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stag1Q9D3E6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stag1Q9D3E6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stag1Q9D3E6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stag1Q9D3E6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stag1Q9D3E6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Stag1Q9D3E6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Stag1Q9D3E6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Stag1Q9D3E6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Stag1Q9D3E6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Stag1Q9D3E6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Stag1Q9D3E6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Stag1Q9D3E6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Stag1Q9D3E6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Stag1Q9D3E6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Stag1Q9D3E6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Stag1Q9D3E6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Stag1Q9D3E6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Stag1Q9D3E6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stag1Q9D3E6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stag1Q9D3E6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stag1Q9D3E6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stag1Q9D3E6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stag1Q9D3E6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stag1Q9D3E6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stag1Q9D3E6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stag1Q9D3E6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stag1Q9D3E6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stag1Q9D3E6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stag1Q9D3E6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stag1Q9D3E6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Stag1Q9D3E6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Stag1Q9D3E6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Stag1Q9D3E6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Stag1Q9D3E6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Stag1Q9D3E6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Stag1Q9D3E6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Stag1Q9D3E6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Stag1Q9D3E6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Stag1Q9D3E6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Stag1Q9D3E6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Stag1Q9D3E6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Stag1Q9D3E6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Stag1Q9D3E6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Stag1Q9D3E6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Stag1Q9D3E6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Stag1Q9D3E6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Stag1Q9D3E6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Stag1Q9D3E6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Stag1Q9D3E6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Stag1Q9D3E6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Stag1Q9D3E6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Stag1Q9D3E6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Stag1Q9D3E6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Stag1Q9D3E6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Stag1Q9D3E6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Stag1Q9D3E6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Stag1Q9D3E6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Stag1Q9D3E6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Stag1Q9D3E6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Stag1Q9D3E6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Stag1Q9D3E6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Stag1Q9D3E6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Stag1Q9D3E6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Stag1Q9D3E6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Stag1Q9D3E6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Stag1Q9D3E6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stag1Q9D3E6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stag1Q9D3E6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Stag1Q9D3E6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Stag1Q9D3E6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Stag1Q9D3E6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Stag1Q9D3E6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms