Protein–RNA interactions for Protein: Q9D300

Rasgef1c, Ras-GEF domain-containing family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1cQ9D300 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rasgef1cQ9D300 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rasgef1cQ9D300 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rasgef1cQ9D300 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rasgef1cQ9D300 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rasgef1cQ9D300 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rasgef1cQ9D300 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rasgef1cQ9D300 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rasgef1cQ9D300 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rasgef1cQ9D300 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rasgef1cQ9D300 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rasgef1cQ9D300 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rasgef1cQ9D300 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rasgef1cQ9D300 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rasgef1cQ9D300 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rasgef1cQ9D300 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rasgef1cQ9D300 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rasgef1cQ9D300 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rasgef1cQ9D300 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rasgef1cQ9D300 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rasgef1cQ9D300 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rasgef1cQ9D300 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rasgef1cQ9D300 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rasgef1cQ9D300 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rasgef1cQ9D300 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rasgef1cQ9D300 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rasgef1cQ9D300 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rasgef1cQ9D300 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rasgef1cQ9D300 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rasgef1cQ9D300 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rasgef1cQ9D300 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rasgef1cQ9D300 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rasgef1cQ9D300 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rasgef1cQ9D300 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rasgef1cQ9D300 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rasgef1cQ9D300 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rasgef1cQ9D300 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rasgef1cQ9D300 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rasgef1cQ9D300 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rasgef1cQ9D300 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rasgef1cQ9D300 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rasgef1cQ9D300 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rasgef1cQ9D300 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rasgef1cQ9D300 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rasgef1cQ9D300 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rasgef1cQ9D300 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rasgef1cQ9D300 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rasgef1cQ9D300 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rasgef1cQ9D300 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rasgef1cQ9D300 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rasgef1cQ9D300 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rasgef1cQ9D300 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rasgef1cQ9D300 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rasgef1cQ9D300 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rasgef1cQ9D300 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rasgef1cQ9D300 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rasgef1cQ9D300 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rasgef1cQ9D300 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rasgef1cQ9D300 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rasgef1cQ9D300 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rasgef1cQ9D300 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rasgef1cQ9D300 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rasgef1cQ9D300 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rasgef1cQ9D300 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rasgef1cQ9D300 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rasgef1cQ9D300 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rasgef1cQ9D300 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rasgef1cQ9D300 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rasgef1cQ9D300 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rasgef1cQ9D300 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rasgef1cQ9D300 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rasgef1cQ9D300 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rasgef1cQ9D300 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rasgef1cQ9D300 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rasgef1cQ9D300 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rasgef1cQ9D300 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rasgef1cQ9D300 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rasgef1cQ9D300 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rasgef1cQ9D300 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rasgef1cQ9D300 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rasgef1cQ9D300 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rasgef1cQ9D300 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rasgef1cQ9D300 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rasgef1cQ9D300 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rasgef1cQ9D300 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rasgef1cQ9D300 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rasgef1cQ9D300 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rasgef1cQ9D300 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rasgef1cQ9D300 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rasgef1cQ9D300 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rasgef1cQ9D300 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rasgef1cQ9D300 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rasgef1cQ9D300 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rasgef1cQ9D300 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rasgef1cQ9D300 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rasgef1cQ9D300 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rasgef1cQ9D300 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rasgef1cQ9D300 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rasgef1cQ9D300 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rasgef1cQ9D300 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms