Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2E3

4930583I09Rik, RIKEN cDNA 4930583I09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930583I09RikQ9D2E3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
4930583I09RikQ9D2E3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930583I09RikQ9D2E3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930583I09RikQ9D2E3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930583I09RikQ9D2E3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930583I09RikQ9D2E3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930583I09RikQ9D2E3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930583I09RikQ9D2E3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930583I09RikQ9D2E3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930583I09RikQ9D2E3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930583I09RikQ9D2E3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930583I09RikQ9D2E3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930583I09RikQ9D2E3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930583I09RikQ9D2E3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930583I09RikQ9D2E3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930583I09RikQ9D2E3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930583I09RikQ9D2E3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930583I09RikQ9D2E3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930583I09RikQ9D2E3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930583I09RikQ9D2E3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930583I09RikQ9D2E3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930583I09RikQ9D2E3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930583I09RikQ9D2E3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930583I09RikQ9D2E3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930583I09RikQ9D2E3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930583I09RikQ9D2E3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930583I09RikQ9D2E3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930583I09RikQ9D2E3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930583I09RikQ9D2E3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930583I09RikQ9D2E3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930583I09RikQ9D2E3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930583I09RikQ9D2E3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
4930583I09RikQ9D2E3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930583I09RikQ9D2E3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
4930583I09RikQ9D2E3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
4930583I09RikQ9D2E3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
4930583I09RikQ9D2E3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930583I09RikQ9D2E3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930583I09RikQ9D2E3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930583I09RikQ9D2E3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930583I09RikQ9D2E3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930583I09RikQ9D2E3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930583I09RikQ9D2E3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930583I09RikQ9D2E3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930583I09RikQ9D2E3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930583I09RikQ9D2E3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms