Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Spns3Q9D232 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Spns3Q9D232 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spns3Q9D232 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spns3Q9D232 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spns3Q9D232 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spns3Q9D232 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spns3Q9D232 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spns3Q9D232 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spns3Q9D232 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spns3Q9D232 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spns3Q9D232 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spns3Q9D232 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spns3Q9D232 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spns3Q9D232 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spns3Q9D232 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Spns3Q9D232 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spns3Q9D232 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spns3Q9D232 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spns3Q9D232 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spns3Q9D232 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spns3Q9D232 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spns3Q9D232 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spns3Q9D232 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spns3Q9D232 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spns3Q9D232 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spns3Q9D232 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spns3Q9D232 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spns3Q9D232 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spns3Q9D232 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spns3Q9D232 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spns3Q9D232 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spns3Q9D232 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spns3Q9D232 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Spns3Q9D232 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spns3Q9D232 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spns3Q9D232 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Spns3Q9D232 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spns3Q9D232 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Spns3Q9D232 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spns3Q9D232 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spns3Q9D232 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spns3Q9D232 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spns3Q9D232 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spns3Q9D232 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spns3Q9D232 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spns3Q9D232 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spns3Q9D232 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spns3Q9D232 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Spns3Q9D232 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Spns3Q9D232 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Spns3Q9D232 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spns3Q9D232 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spns3Q9D232 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spns3Q9D232 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Spns3Q9D232 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spns3Q9D232 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spns3Q9D232 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spns3Q9D232 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Spns3Q9D232 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spns3Q9D232 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Spns3Q9D232 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spns3Q9D232 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spns3Q9D232 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spns3Q9D232 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spns3Q9D232 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spns3Q9D232 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spns3Q9D232 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Spns3Q9D232 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spns3Q9D232 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spns3Q9D232 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spns3Q9D232 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spns3Q9D232 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spns3Q9D232 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spns3Q9D232 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spns3Q9D232 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spns3Q9D232 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spns3Q9D232 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spns3Q9D232 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spns3Q9D232 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spns3Q9D232 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spns3Q9D232 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spns3Q9D232 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spns3Q9D232 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spns3Q9D232 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spns3Q9D232 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spns3Q9D232 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spns3Q9D232 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spns3Q9D232 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spns3Q9D232 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spns3Q9D232 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spns3Q9D232 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spns3Q9D232 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spns3Q9D232 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spns3Q9D232 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spns3Q9D232 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spns3Q9D232 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spns3Q9D232 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spns3Q9D232 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spns3Q9D232 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms