Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1M0

Sec13, Protein SEC13 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec13Q9D1M0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec13Q9D1M0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec13Q9D1M0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec13Q9D1M0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec13Q9D1M0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec13Q9D1M0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec13Q9D1M0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec13Q9D1M0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec13Q9D1M0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sec13Q9D1M0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sec13Q9D1M0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sec13Q9D1M0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sec13Q9D1M0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sec13Q9D1M0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sec13Q9D1M0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sec13Q9D1M0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec13Q9D1M0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec13Q9D1M0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec13Q9D1M0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec13Q9D1M0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec13Q9D1M0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec13Q9D1M0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec13Q9D1M0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec13Q9D1M0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec13Q9D1M0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec13Q9D1M0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec13Q9D1M0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec13Q9D1M0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec13Q9D1M0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec13Q9D1M0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sec13Q9D1M0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sec13Q9D1M0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sec13Q9D1M0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sec13Q9D1M0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec13Q9D1M0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec13Q9D1M0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec13Q9D1M0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec13Q9D1M0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec13Q9D1M0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec13Q9D1M0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec13Q9D1M0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec13Q9D1M0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec13Q9D1M0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec13Q9D1M0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec13Q9D1M0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec13Q9D1M0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec13Q9D1M0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec13Q9D1M0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec13Q9D1M0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec13Q9D1M0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec13Q9D1M0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec13Q9D1M0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sec13Q9D1M0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sec13Q9D1M0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sec13Q9D1M0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sec13Q9D1M0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sec13Q9D1M0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sec13Q9D1M0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sec13Q9D1M0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sec13Q9D1M0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sec13Q9D1M0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sec13Q9D1M0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sec13Q9D1M0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec13Q9D1M0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec13Q9D1M0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec13Q9D1M0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec13Q9D1M0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec13Q9D1M0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec13Q9D1M0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec13Q9D1M0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec13Q9D1M0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec13Q9D1M0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec13Q9D1M0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec13Q9D1M0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec13Q9D1M0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec13Q9D1M0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec13Q9D1M0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec13Q9D1M0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec13Q9D1M0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sec13Q9D1M0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sec13Q9D1M0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sec13Q9D1M0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sec13Q9D1M0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sec13Q9D1M0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sec13Q9D1M0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sec13Q9D1M0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sec13Q9D1M0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sec13Q9D1M0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sec13Q9D1M0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sec13Q9D1M0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec13Q9D1M0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec13Q9D1M0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec13Q9D1M0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec13Q9D1M0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec13Q9D1M0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec13Q9D1M0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec13Q9D1M0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec13Q9D1M0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec13Q9D1M0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec13Q9D1M0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms