Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ube2cQ9D1C1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ube2cQ9D1C1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2cQ9D1C1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2cQ9D1C1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2cQ9D1C1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2cQ9D1C1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Ube2cQ9D1C1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2cQ9D1C1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2cQ9D1C1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2cQ9D1C1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2cQ9D1C1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2cQ9D1C1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2cQ9D1C1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2cQ9D1C1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2cQ9D1C1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2cQ9D1C1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2cQ9D1C1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2cQ9D1C1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2cQ9D1C1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2cQ9D1C1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2cQ9D1C1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2cQ9D1C1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Ube2cQ9D1C1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2cQ9D1C1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Ube2cQ9D1C1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2cQ9D1C1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2cQ9D1C1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2cQ9D1C1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2cQ9D1C1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2cQ9D1C1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2cQ9D1C1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2cQ9D1C1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2cQ9D1C1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2cQ9D1C1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2cQ9D1C1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2cQ9D1C1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2cQ9D1C1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ube2cQ9D1C1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2cQ9D1C1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2cQ9D1C1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2cQ9D1C1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2cQ9D1C1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2cQ9D1C1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2cQ9D1C1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2cQ9D1C1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2cQ9D1C1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2cQ9D1C1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2cQ9D1C1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2cQ9D1C1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
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Ube2cQ9D1C1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms