Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0K1

Pex13, Peroxisomal membrane protein PEX13, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex13Q9D0K1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pex13Q9D0K1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pex13Q9D0K1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pex13Q9D0K1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pex13Q9D0K1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pex13Q9D0K1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pex13Q9D0K1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Pex13Q9D0K1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pex13Q9D0K1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pex13Q9D0K1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pex13Q9D0K1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pex13Q9D0K1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Pex13Q9D0K1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pex13Q9D0K1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pex13Q9D0K1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pex13Q9D0K1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pex13Q9D0K1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pex13Q9D0K1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pex13Q9D0K1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pex13Q9D0K1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pex13Q9D0K1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Pex13Q9D0K1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pex13Q9D0K1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pex13Q9D0K1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pex13Q9D0K1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pex13Q9D0K1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pex13Q9D0K1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pex13Q9D0K1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pex13Q9D0K1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pex13Q9D0K1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pex13Q9D0K1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pex13Q9D0K1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pex13Q9D0K1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Pex13Q9D0K1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pex13Q9D0K1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pex13Q9D0K1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pex13Q9D0K1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pex13Q9D0K1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pex13Q9D0K1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pex13Q9D0K1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pex13Q9D0K1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pex13Q9D0K1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pex13Q9D0K1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Pex13Q9D0K1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Pex13Q9D0K1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Pex13Q9D0K1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pex13Q9D0K1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pex13Q9D0K1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pex13Q9D0K1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pex13Q9D0K1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms