Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F4

Nkap, NF-kappa-B-activating protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkapQ9D0F4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NkapQ9D0F4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NkapQ9D0F4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NkapQ9D0F4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NkapQ9D0F4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NkapQ9D0F4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NkapQ9D0F4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NkapQ9D0F4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NkapQ9D0F4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NkapQ9D0F4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NkapQ9D0F4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NkapQ9D0F4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NkapQ9D0F4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NkapQ9D0F4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NkapQ9D0F4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NkapQ9D0F4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NkapQ9D0F4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NkapQ9D0F4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NkapQ9D0F4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NkapQ9D0F4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NkapQ9D0F4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NkapQ9D0F4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NkapQ9D0F4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NkapQ9D0F4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NkapQ9D0F4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NkapQ9D0F4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NkapQ9D0F4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NkapQ9D0F4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NkapQ9D0F4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NkapQ9D0F4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NkapQ9D0F4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NkapQ9D0F4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NkapQ9D0F4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NkapQ9D0F4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NkapQ9D0F4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NkapQ9D0F4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NkapQ9D0F4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NkapQ9D0F4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NkapQ9D0F4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NkapQ9D0F4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NkapQ9D0F4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NkapQ9D0F4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NkapQ9D0F4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NkapQ9D0F4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NkapQ9D0F4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NkapQ9D0F4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NkapQ9D0F4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NkapQ9D0F4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NkapQ9D0F4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NkapQ9D0F4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NkapQ9D0F4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NkapQ9D0F4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NkapQ9D0F4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NkapQ9D0F4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NkapQ9D0F4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NkapQ9D0F4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NkapQ9D0F4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NkapQ9D0F4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NkapQ9D0F4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NkapQ9D0F4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NkapQ9D0F4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NkapQ9D0F4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NkapQ9D0F4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NkapQ9D0F4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NkapQ9D0F4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NkapQ9D0F4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NkapQ9D0F4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NkapQ9D0F4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NkapQ9D0F4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NkapQ9D0F4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NkapQ9D0F4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NkapQ9D0F4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NkapQ9D0F4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NkapQ9D0F4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NkapQ9D0F4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NkapQ9D0F4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NkapQ9D0F4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NkapQ9D0F4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NkapQ9D0F4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NkapQ9D0F4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NkapQ9D0F4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NkapQ9D0F4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NkapQ9D0F4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NkapQ9D0F4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NkapQ9D0F4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NkapQ9D0F4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NkapQ9D0F4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NkapQ9D0F4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NkapQ9D0F4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NkapQ9D0F4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NkapQ9D0F4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NkapQ9D0F4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NkapQ9D0F4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NkapQ9D0F4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NkapQ9D0F4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NkapQ9D0F4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NkapQ9D0F4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NkapQ9D0F4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NkapQ9D0F4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NkapQ9D0F4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms