Protein–RNA interactions for Protein: Q9D061

Acbd6, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acbd6Q9D061 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Acbd6Q9D061 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Acbd6Q9D061 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Acbd6Q9D061 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Acbd6Q9D061 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Acbd6Q9D061 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Acbd6Q9D061 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Acbd6Q9D061 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Acbd6Q9D061 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Acbd6Q9D061 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Acbd6Q9D061 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Acbd6Q9D061 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Acbd6Q9D061 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Acbd6Q9D061 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Acbd6Q9D061 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Acbd6Q9D061 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Acbd6Q9D061 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Acbd6Q9D061 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Acbd6Q9D061 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acbd6Q9D061 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acbd6Q9D061 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acbd6Q9D061 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acbd6Q9D061 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acbd6Q9D061 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acbd6Q9D061 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acbd6Q9D061 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acbd6Q9D061 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acbd6Q9D061 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Acbd6Q9D061 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Acbd6Q9D061 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Acbd6Q9D061 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Acbd6Q9D061 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Acbd6Q9D061 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Acbd6Q9D061 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Acbd6Q9D061 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Acbd6Q9D061 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Acbd6Q9D061 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acbd6Q9D061 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acbd6Q9D061 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acbd6Q9D061 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acbd6Q9D061 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acbd6Q9D061 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acbd6Q9D061 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acbd6Q9D061 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Acbd6Q9D061 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Acbd6Q9D061 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Acbd6Q9D061 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Acbd6Q9D061 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Acbd6Q9D061 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Acbd6Q9D061 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Acbd6Q9D061 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Acbd6Q9D061 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Acbd6Q9D061 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Acbd6Q9D061 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Acbd6Q9D061 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Acbd6Q9D061 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Acbd6Q9D061 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Acbd6Q9D061 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Acbd6Q9D061 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Acbd6Q9D061 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Acbd6Q9D061 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Acbd6Q9D061 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Acbd6Q9D061 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Acbd6Q9D061 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Acbd6Q9D061 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Acbd6Q9D061 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Acbd6Q9D061 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Acbd6Q9D061 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Acbd6Q9D061 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Acbd6Q9D061 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Acbd6Q9D061 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Acbd6Q9D061 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Acbd6Q9D061 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Acbd6Q9D061 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Acbd6Q9D061 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Acbd6Q9D061 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Acbd6Q9D061 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Acbd6Q9D061 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Acbd6Q9D061 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acbd6Q9D061 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acbd6Q9D061 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Acbd6Q9D061 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acbd6Q9D061 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Acbd6Q9D061 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acbd6Q9D061 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acbd6Q9D061 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acbd6Q9D061 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acbd6Q9D061 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acbd6Q9D061 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Acbd6Q9D061 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Acbd6Q9D061 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Acbd6Q9D061 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Acbd6Q9D061 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Acbd6Q9D061 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Acbd6Q9D061 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Acbd6Q9D061 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Acbd6Q9D061 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Acbd6Q9D061 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Acbd6Q9D061 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Acbd6Q9D061 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139 ms