Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snf8Q9CZ28 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snf8Q9CZ28 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snf8Q9CZ28 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Snf8Q9CZ28 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snf8Q9CZ28 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snf8Q9CZ28 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Snf8Q9CZ28 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snf8Q9CZ28 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snf8Q9CZ28 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snf8Q9CZ28 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snf8Q9CZ28 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snf8Q9CZ28 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snf8Q9CZ28 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Snf8Q9CZ28 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snf8Q9CZ28 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snf8Q9CZ28 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Snf8Q9CZ28 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snf8Q9CZ28 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Snf8Q9CZ28 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Snf8Q9CZ28 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snf8Q9CZ28 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snf8Q9CZ28 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snf8Q9CZ28 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snf8Q9CZ28 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snf8Q9CZ28 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snf8Q9CZ28 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snf8Q9CZ28 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snf8Q9CZ28 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snf8Q9CZ28 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snf8Q9CZ28 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snf8Q9CZ28 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snf8Q9CZ28 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snf8Q9CZ28 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Snf8Q9CZ28 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Snf8Q9CZ28 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snf8Q9CZ28 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snf8Q9CZ28 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snf8Q9CZ28 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snf8Q9CZ28 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snf8Q9CZ28 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snf8Q9CZ28 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snf8Q9CZ28 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snf8Q9CZ28 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snf8Q9CZ28 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snf8Q9CZ28 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snf8Q9CZ28 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snf8Q9CZ28 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snf8Q9CZ28 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snf8Q9CZ28 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snf8Q9CZ28 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snf8Q9CZ28 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snf8Q9CZ28 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snf8Q9CZ28 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snf8Q9CZ28 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snf8Q9CZ28 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snf8Q9CZ28 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snf8Q9CZ28 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snf8Q9CZ28 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snf8Q9CZ28 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snf8Q9CZ28 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snf8Q9CZ28 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Snf8Q9CZ28 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Snf8Q9CZ28 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Snf8Q9CZ28 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snf8Q9CZ28 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snf8Q9CZ28 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snf8Q9CZ28 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snf8Q9CZ28 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snf8Q9CZ28 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Snf8Q9CZ28 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snf8Q9CZ28 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snf8Q9CZ28 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snf8Q9CZ28 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Snf8Q9CZ28 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snf8Q9CZ28 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snf8Q9CZ28 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snf8Q9CZ28 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snf8Q9CZ28 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snf8Q9CZ28 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snf8Q9CZ28 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snf8Q9CZ28 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snf8Q9CZ28 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snf8Q9CZ28 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snf8Q9CZ28 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snf8Q9CZ28 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snf8Q9CZ28 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snf8Q9CZ28 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snf8Q9CZ28 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snf8Q9CZ28 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snf8Q9CZ28 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snf8Q9CZ28 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snf8Q9CZ28 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snf8Q9CZ28 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snf8Q9CZ28 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snf8Q9CZ28 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snf8Q9CZ28 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snf8Q9CZ28 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snf8Q9CZ28 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snf8Q9CZ28 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms