Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ssu72Q9CY97 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ssu72Q9CY97 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ssu72Q9CY97 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ssu72Q9CY97 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ssu72Q9CY97 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ssu72Q9CY97 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ssu72Q9CY97 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ssu72Q9CY97 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ssu72Q9CY97 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ssu72Q9CY97 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ssu72Q9CY97 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ssu72Q9CY97 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ssu72Q9CY97 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssu72Q9CY97 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssu72Q9CY97 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssu72Q9CY97 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssu72Q9CY97 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssu72Q9CY97 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssu72Q9CY97 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssu72Q9CY97 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssu72Q9CY97 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssu72Q9CY97 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssu72Q9CY97 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssu72Q9CY97 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssu72Q9CY97 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssu72Q9CY97 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssu72Q9CY97 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssu72Q9CY97 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ssu72Q9CY97 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ssu72Q9CY97 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ssu72Q9CY97 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ssu72Q9CY97 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ssu72Q9CY97 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ssu72Q9CY97 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Ssu72Q9CY97 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ssu72Q9CY97 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ssu72Q9CY97 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ssu72Q9CY97 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ssu72Q9CY97 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ssu72Q9CY97 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ssu72Q9CY97 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ssu72Q9CY97 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ssu72Q9CY97 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ssu72Q9CY97 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ssu72Q9CY97 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ssu72Q9CY97 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ssu72Q9CY97 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ssu72Q9CY97 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ssu72Q9CY97 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ssu72Q9CY97 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ssu72Q9CY97 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ssu72Q9CY97 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ssu72Q9CY97 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ssu72Q9CY97 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ssu72Q9CY97 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ssu72Q9CY97 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ssu72Q9CY97 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ssu72Q9CY97 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ssu72Q9CY97 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ssu72Q9CY97 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ssu72Q9CY97 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ssu72Q9CY97 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ssu72Q9CY97 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ssu72Q9CY97 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ssu72Q9CY97 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ssu72Q9CY97 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ssu72Q9CY97 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ssu72Q9CY97 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ssu72Q9CY97 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ssu72Q9CY97 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ssu72Q9CY97 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ssu72Q9CY97 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ssu72Q9CY97 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ssu72Q9CY97 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ssu72Q9CY97 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ssu72Q9CY97 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ssu72Q9CY97 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ssu72Q9CY97 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ssu72Q9CY97 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ssu72Q9CY97 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ssu72Q9CY97 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ssu72Q9CY97 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ssu72Q9CY97 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ssu72Q9CY97 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ssu72Q9CY97 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ssu72Q9CY97 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ssu72Q9CY97 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ssu72Q9CY97 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ssu72Q9CY97 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ssu72Q9CY97 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ssu72Q9CY97 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ssu72Q9CY97 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ssu72Q9CY97 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ssu72Q9CY97 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ssu72Q9CY97 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ssu72Q9CY97 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ssu72Q9CY97 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ssu72Q9CY97 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ssu72Q9CY97 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms