Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY50

Ssr1, Translocon-associated protein subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr1Q9CY50 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ssr1Q9CY50 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ssr1Q9CY50 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ssr1Q9CY50 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ssr1Q9CY50 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ssr1Q9CY50 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ssr1Q9CY50 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ssr1Q9CY50 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ssr1Q9CY50 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ssr1Q9CY50 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ssr1Q9CY50 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ssr1Q9CY50 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ssr1Q9CY50 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ssr1Q9CY50 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ssr1Q9CY50 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ssr1Q9CY50 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ssr1Q9CY50 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ssr1Q9CY50 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ssr1Q9CY50 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ssr1Q9CY50 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ssr1Q9CY50 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ssr1Q9CY50 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ssr1Q9CY50 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ssr1Q9CY50 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ssr1Q9CY50 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ssr1Q9CY50 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssr1Q9CY50 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssr1Q9CY50 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssr1Q9CY50 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssr1Q9CY50 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssr1Q9CY50 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssr1Q9CY50 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssr1Q9CY50 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssr1Q9CY50 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssr1Q9CY50 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssr1Q9CY50 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ssr1Q9CY50 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ssr1Q9CY50 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssr1Q9CY50 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssr1Q9CY50 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssr1Q9CY50 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssr1Q9CY50 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssr1Q9CY50 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssr1Q9CY50 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssr1Q9CY50 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssr1Q9CY50 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssr1Q9CY50 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssr1Q9CY50 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssr1Q9CY50 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssr1Q9CY50 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssr1Q9CY50 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssr1Q9CY50 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssr1Q9CY50 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssr1Q9CY50 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssr1Q9CY50 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssr1Q9CY50 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssr1Q9CY50 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ssr1Q9CY50 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ssr1Q9CY50 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ssr1Q9CY50 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ssr1Q9CY50 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ssr1Q9CY50 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ssr1Q9CY50 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ssr1Q9CY50 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ssr1Q9CY50 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ssr1Q9CY50 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ssr1Q9CY50 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ssr1Q9CY50 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ssr1Q9CY50 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ssr1Q9CY50 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ssr1Q9CY50 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ssr1Q9CY50 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ssr1Q9CY50 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ssr1Q9CY50 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ssr1Q9CY50 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ssr1Q9CY50 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ssr1Q9CY50 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ssr1Q9CY50 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ssr1Q9CY50 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ssr1Q9CY50 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ssr1Q9CY50 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ssr1Q9CY50 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ssr1Q9CY50 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ssr1Q9CY50 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ssr1Q9CY50 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ssr1Q9CY50 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ssr1Q9CY50 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssr1Q9CY50 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssr1Q9CY50 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssr1Q9CY50 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssr1Q9CY50 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssr1Q9CY50 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssr1Q9CY50 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssr1Q9CY50 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ssr1Q9CY50 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ssr1Q9CY50 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ssr1Q9CY50 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ssr1Q9CY50 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ssr1Q9CY50 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ssr1Q9CY50 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms