Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL3

Uncharacterized protein C7orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CXL3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9CXL3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9CXL3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9CXL3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9CXL3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9CXL3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9CXL3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9CXL3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9CXL3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9CXL3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9CXL3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9CXL3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9CXL3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9CXL3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9CXL3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9CXL3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9CXL3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9CXL3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9CXL3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9CXL3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9CXL3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9CXL3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9CXL3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9CXL3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9CXL3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9CXL3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9CXL3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9CXL3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9CXL3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9CXL3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9CXL3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9CXL3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9CXL3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9CXL3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9CXL3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9CXL3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9CXL3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9CXL3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9CXL3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9CXL3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9CXL3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9CXL3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9CXL3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9CXL3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9CXL3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9CXL3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9CXL3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9CXL3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9CXL3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CXL3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CXL3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CXL3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CXL3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CXL3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CXL3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CXL3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CXL3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CXL3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9CXL3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9CXL3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9CXL3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9CXL3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9CXL3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9CXL3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9CXL3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9CXL3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9CXL3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9CXL3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9CXL3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9CXL3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9CXL3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q9CXL3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q9CXL3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q9CXL3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9CXL3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9CXL3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9CXL3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9CXL3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9CXL3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9CXL3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9CXL3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9CXL3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9CXL3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9CXL3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9CXL3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9CXL3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9CXL3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9CXL3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9CXL3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9CXL3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9CXL3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9CXL3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9CXL3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9CXL3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9CXL3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9CXL3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9CXL3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9CXL3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9CXL3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9CXL3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms