Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nip7Q9CXK8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nip7Q9CXK8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nip7Q9CXK8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nip7Q9CXK8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nip7Q9CXK8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Nip7Q9CXK8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nip7Q9CXK8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nip7Q9CXK8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nip7Q9CXK8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nip7Q9CXK8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nip7Q9CXK8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nip7Q9CXK8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nip7Q9CXK8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nip7Q9CXK8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nip7Q9CXK8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Nip7Q9CXK8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nip7Q9CXK8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nip7Q9CXK8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nip7Q9CXK8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nip7Q9CXK8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nip7Q9CXK8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nip7Q9CXK8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nip7Q9CXK8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nip7Q9CXK8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nip7Q9CXK8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nip7Q9CXK8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Nip7Q9CXK8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nip7Q9CXK8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nip7Q9CXK8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nip7Q9CXK8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nip7Q9CXK8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nip7Q9CXK8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nip7Q9CXK8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nip7Q9CXK8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nip7Q9CXK8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nip7Q9CXK8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nip7Q9CXK8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nip7Q9CXK8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nip7Q9CXK8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Nip7Q9CXK8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Nip7Q9CXK8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nip7Q9CXK8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nip7Q9CXK8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nip7Q9CXK8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nip7Q9CXK8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Nip7Q9CXK8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nip7Q9CXK8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Nip7Q9CXK8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nip7Q9CXK8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nip7Q9CXK8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nip7Q9CXK8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nip7Q9CXK8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nip7Q9CXK8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Nip7Q9CXK8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nip7Q9CXK8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nip7Q9CXK8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Nip7Q9CXK8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nip7Q9CXK8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nip7Q9CXK8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nip7Q9CXK8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nip7Q9CXK8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nip7Q9CXK8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nip7Q9CXK8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nip7Q9CXK8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Nip7Q9CXK8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nip7Q9CXK8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nip7Q9CXK8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nip7Q9CXK8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nip7Q9CXK8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nip7Q9CXK8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nip7Q9CXK8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nip7Q9CXK8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nip7Q9CXK8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nip7Q9CXK8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nip7Q9CXK8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Nip7Q9CXK8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nip7Q9CXK8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Nip7Q9CXK8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Nip7Q9CXK8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nip7Q9CXK8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nip7Q9CXK8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nip7Q9CXK8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nip7Q9CXK8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nip7Q9CXK8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nip7Q9CXK8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nip7Q9CXK8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nip7Q9CXK8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nip7Q9CXK8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nip7Q9CXK8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nip7Q9CXK8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nip7Q9CXK8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nip7Q9CXK8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nip7Q9CXK8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nip7Q9CXK8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nip7Q9CXK8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nip7Q9CXK8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nip7Q9CXK8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nip7Q9CXK8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nip7Q9CXK8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms