Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cxxc1Q9CWW7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cxxc1Q9CWW7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cxxc1Q9CWW7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cxxc1Q9CWW7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cxxc1Q9CWW7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cxxc1Q9CWW7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cxxc1Q9CWW7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cxxc1Q9CWW7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cxxc1Q9CWW7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cxxc1Q9CWW7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cxxc1Q9CWW7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cxxc1Q9CWW7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cxxc1Q9CWW7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cxxc1Q9CWW7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cxxc1Q9CWW7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cxxc1Q9CWW7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cxxc1Q9CWW7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cxxc1Q9CWW7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cxxc1Q9CWW7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cxxc1Q9CWW7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cxxc1Q9CWW7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cxxc1Q9CWW7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cxxc1Q9CWW7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cxxc1Q9CWW7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cxxc1Q9CWW7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cxxc1Q9CWW7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cxxc1Q9CWW7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cxxc1Q9CWW7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cxxc1Q9CWW7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cxxc1Q9CWW7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cxxc1Q9CWW7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cxxc1Q9CWW7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cxxc1Q9CWW7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cxxc1Q9CWW7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cxxc1Q9CWW7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cxxc1Q9CWW7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cxxc1Q9CWW7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cxxc1Q9CWW7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cxxc1Q9CWW7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cxxc1Q9CWW7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cxxc1Q9CWW7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cxxc1Q9CWW7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cxxc1Q9CWW7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cxxc1Q9CWW7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cxxc1Q9CWW7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cxxc1Q9CWW7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cxxc1Q9CWW7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cxxc1Q9CWW7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cxxc1Q9CWW7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cxxc1Q9CWW7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cxxc1Q9CWW7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cxxc1Q9CWW7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cxxc1Q9CWW7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cxxc1Q9CWW7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cxxc1Q9CWW7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cxxc1Q9CWW7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cxxc1Q9CWW7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cxxc1Q9CWW7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cxxc1Q9CWW7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cxxc1Q9CWW7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cxxc1Q9CWW7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cxxc1Q9CWW7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cxxc1Q9CWW7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cxxc1Q9CWW7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cxxc1Q9CWW7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cxxc1Q9CWW7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cxxc1Q9CWW7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cxxc1Q9CWW7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cxxc1Q9CWW7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cxxc1Q9CWW7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cxxc1Q9CWW7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cxxc1Q9CWW7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cxxc1Q9CWW7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cxxc1Q9CWW7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cxxc1Q9CWW7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cxxc1Q9CWW7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cxxc1Q9CWW7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cxxc1Q9CWW7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cxxc1Q9CWW7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cxxc1Q9CWW7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cxxc1Q9CWW7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cxxc1Q9CWW7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cxxc1Q9CWW7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cxxc1Q9CWW7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cxxc1Q9CWW7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cxxc1Q9CWW7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cxxc1Q9CWW7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cxxc1Q9CWW7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cxxc1Q9CWW7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cxxc1Q9CWW7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cxxc1Q9CWW7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cxxc1Q9CWW7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cxxc1Q9CWW7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cxxc1Q9CWW7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cxxc1Q9CWW7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cxxc1Q9CWW7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cxxc1Q9CWW7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxxc1Q9CWW7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxxc1Q9CWW7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms