Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pin4Q9CWW6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pin4Q9CWW6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pin4Q9CWW6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pin4Q9CWW6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pin4Q9CWW6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pin4Q9CWW6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pin4Q9CWW6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pin4Q9CWW6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pin4Q9CWW6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pin4Q9CWW6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pin4Q9CWW6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pin4Q9CWW6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pin4Q9CWW6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pin4Q9CWW6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pin4Q9CWW6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pin4Q9CWW6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pin4Q9CWW6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pin4Q9CWW6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pin4Q9CWW6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pin4Q9CWW6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pin4Q9CWW6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pin4Q9CWW6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pin4Q9CWW6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pin4Q9CWW6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pin4Q9CWW6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pin4Q9CWW6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pin4Q9CWW6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pin4Q9CWW6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pin4Q9CWW6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pin4Q9CWW6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pin4Q9CWW6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pin4Q9CWW6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pin4Q9CWW6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pin4Q9CWW6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pin4Q9CWW6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pin4Q9CWW6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pin4Q9CWW6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pin4Q9CWW6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pin4Q9CWW6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pin4Q9CWW6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pin4Q9CWW6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pin4Q9CWW6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pin4Q9CWW6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pin4Q9CWW6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pin4Q9CWW6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pin4Q9CWW6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pin4Q9CWW6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pin4Q9CWW6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pin4Q9CWW6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pin4Q9CWW6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pin4Q9CWW6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pin4Q9CWW6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pin4Q9CWW6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pin4Q9CWW6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pin4Q9CWW6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pin4Q9CWW6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pin4Q9CWW6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pin4Q9CWW6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pin4Q9CWW6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pin4Q9CWW6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pin4Q9CWW6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pin4Q9CWW6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pin4Q9CWW6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pin4Q9CWW6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pin4Q9CWW6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pin4Q9CWW6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pin4Q9CWW6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pin4Q9CWW6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pin4Q9CWW6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pin4Q9CWW6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pin4Q9CWW6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pin4Q9CWW6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pin4Q9CWW6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pin4Q9CWW6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pin4Q9CWW6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pin4Q9CWW6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pin4Q9CWW6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pin4Q9CWW6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pin4Q9CWW6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pin4Q9CWW6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pin4Q9CWW6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pin4Q9CWW6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pin4Q9CWW6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pin4Q9CWW6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pin4Q9CWW6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pin4Q9CWW6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pin4Q9CWW6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pin4Q9CWW6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pin4Q9CWW6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pin4Q9CWW6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pin4Q9CWW6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pin4Q9CWW6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pin4Q9CWW6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pin4Q9CWW6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pin4Q9CWW6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pin4Q9CWW6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pin4Q9CWW6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pin4Q9CWW6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pin4Q9CWW6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms