Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW03

Smc3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc3Q9CW03 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smc3Q9CW03 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smc3Q9CW03 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smc3Q9CW03 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smc3Q9CW03 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smc3Q9CW03 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smc3Q9CW03 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smc3Q9CW03 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Smc3Q9CW03 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smc3Q9CW03 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smc3Q9CW03 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smc3Q9CW03 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smc3Q9CW03 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smc3Q9CW03 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Smc3Q9CW03 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smc3Q9CW03 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Smc3Q9CW03 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smc3Q9CW03 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smc3Q9CW03 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smc3Q9CW03 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smc3Q9CW03 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smc3Q9CW03 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smc3Q9CW03 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smc3Q9CW03 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Smc3Q9CW03 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smc3Q9CW03 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smc3Q9CW03 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smc3Q9CW03 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smc3Q9CW03 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smc3Q9CW03 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Smc3Q9CW03 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smc3Q9CW03 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smc3Q9CW03 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smc3Q9CW03 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smc3Q9CW03 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smc3Q9CW03 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smc3Q9CW03 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smc3Q9CW03 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smc3Q9CW03 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smc3Q9CW03 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smc3Q9CW03 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smc3Q9CW03 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smc3Q9CW03 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smc3Q9CW03 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smc3Q9CW03 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smc3Q9CW03 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smc3Q9CW03 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smc3Q9CW03 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smc3Q9CW03 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smc3Q9CW03 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smc3Q9CW03 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smc3Q9CW03 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smc3Q9CW03 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smc3Q9CW03 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smc3Q9CW03 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smc3Q9CW03 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smc3Q9CW03 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smc3Q9CW03 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Smc3Q9CW03 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smc3Q9CW03 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Smc3Q9CW03 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Smc3Q9CW03 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smc3Q9CW03 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Smc3Q9CW03 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smc3Q9CW03 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smc3Q9CW03 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smc3Q9CW03 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smc3Q9CW03 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smc3Q9CW03 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smc3Q9CW03 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smc3Q9CW03 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smc3Q9CW03 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smc3Q9CW03 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smc3Q9CW03 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smc3Q9CW03 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Smc3Q9CW03 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smc3Q9CW03 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smc3Q9CW03 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smc3Q9CW03 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smc3Q9CW03 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smc3Q9CW03 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smc3Q9CW03 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smc3Q9CW03 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smc3Q9CW03 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smc3Q9CW03 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smc3Q9CW03 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smc3Q9CW03 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smc3Q9CW03 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smc3Q9CW03 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smc3Q9CW03 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Smc3Q9CW03 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smc3Q9CW03 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smc3Q9CW03 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smc3Q9CW03 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smc3Q9CW03 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smc3Q9CW03 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Smc3Q9CW03 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smc3Q9CW03 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smc3Q9CW03 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smc3Q9CW03 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms